69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3939 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A3939  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.698745  hitchhiker  0.0000139678 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2398  hypothetical protein  41.49 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  35.92 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  34.02 
 
 		 497 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1387  hypothetical protein  41.57 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal  0.263162 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0626  hypothetical protein  34.58 
 
 		 405 aa  58.9  0.00000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0144  hypothetical protein  38.82 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7625  hypothetical protein  36.14 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1128  hypothetical protein  28.1 
 
 		 462 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3770  hypothetical protein  35.48 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  40 
 
 		 446 aa  56.2  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  33.01 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4262  hypothetical protein  26.37 
 
 		 479 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109505  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1321  hypothetical protein  27.08 
 
 		 405 aa  55.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.113057  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1492  hypothetical protein  36.17 
 
 		 222 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176688  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5126  hypothetical protein  34.52 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0822  hypothetical protein  35.06 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38987  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3563  hypothetical protein  22.28 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4215  hypothetical protein  32.94 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5742  hypothetical protein  33.33 
 
 		 272 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.065133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2536  hypothetical protein  30.48 
 
 		 231 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07118  hypothetical protein  32.94 
 
 		 197 aa  53.9  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3702  hypothetical protein  29.17 
 
 		 206 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4591  hypothetical protein  30.77 
 
 		 166 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5200  hypothetical protein  33.33 
 
 		 306 aa  52.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.782608  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4023  hypothetical protein  33.33 
 
 		 266 aa  52  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2634  hypothetical protein  34.02 
 
 		 192 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579802  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5697  hypothetical protein  29.81 
 
 		 123 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357186 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4134  hypothetical protein  30.95 
 
 		 309 aa  49.7  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5844  hypothetical protein  30.69 
 
 		 341 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.914244 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4006  hypothetical protein  28 
 
 		 211 aa  49.3  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6360  lipoprotein  32.91 
 
 		 296 aa  48.9  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.419648 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4415  hypothetical protein  31.76 
 
 		 307 aa  48.9  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3927  hypothetical protein  39.39 
 
 		 214 aa  48.9  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4726  hypothetical protein  35.44 
 
 		 339 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62609  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0112  hypothetical protein  30.51 
 
 		 207 aa  47.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  30 
 
 		 463 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1150  hypothetical protein  34.74 
 
 		 122 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000576918  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0115  protein of unknown function DUF1311  33.72 
 
 		 212 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0722  hypothetical protein  30.23 
 
 		 877 aa  46.6  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  30.86 
 
 		 100 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  31.65 
 
 		 225 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0111  hypothetical protein  33.33 
 
 		 212 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6415  hypothetical protein  27.08 
 
 		 245 aa  45.4  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1414  hypothetical protein  27.08 
 
 		 245 aa  45.4  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1865  hypothetical protein  34.92 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7075  lipoprotein-like protein  27.08 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.446576 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0108  hypothetical protein  25.86 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2073  hypothetical protein  32.58 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.955864  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4255  hypothetical protein  27.55 
 
 		 111 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0581394  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0619  hypothetical protein  29.47 
 
 		 331 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0113  hypothetical protein  24.35 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357607 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0699  hypothetical protein  29.47 
 
 		 331 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.951363  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0116  hypothetical protein  33.33 
 
 		 212 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3785  hypothetical protein  31.65 
 
 		 570 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.477688 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11574  lipoprotein lprI  27.91 
 
 		 197 aa  43.9  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0108  hypothetical protein  26.96 
 
 		 206 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2826  twin-arginine translocation pathway signal  36.49 
 
 		 434 aa  43.9  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1315  putative secreted protein  26.13 
 
 		 109 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.133437 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1337  putative secreted protein  26.13 
 
 		 109 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.040885 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1362  hypothetical protein  30.53 
 
 		 117 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0128384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2130  hypothetical protein  26.13 
 
 		 109 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698571 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1948  putative secreted protein  26.13 
 
 		 109 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0113  hypothetical protein  26.79 
 
 		 128 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.785467 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1353  putative secreted protein  26.13 
 
 		 109 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.925839  normal  0.442542 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0757  hypothetical protein  31.33 
 
 		 208 aa  43.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000233286  normal  0.28167 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4296  hypothetical protein  25.81 
 
 		 119 aa  43.1  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811725  decreased coverage  0.00880745 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49960  hypothetical protein  31.76 
 
 		 111 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1599  hypothetical protein  26.09 
 
 		 214 aa  42.7  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372929  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>