141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C2467 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2467  DNA polymerase V subunit  100 
 
 		 223 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0775878  hitchhiker  0.000992934 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1055  DNA polymerase V subunit  72.09 
 
 		 128 aa  210  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.158623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1883  hypothetical protein  46.34 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156708 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2163  DNA polymerase V subunit UmuD  44.54 
 
 		 139 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.21769  normal  0.16696 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2159  DNA polymerase V subunit UmuD  44.54 
 
 		 139 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0649907  normal  0.799601 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2216  DNA polymerase V subunit UmuD  44.54 
 
 		 139 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113166  normal  0.676536 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01158  DNA polymerase V, subunit D  40.34 
 
 		 139 aa  94  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000619271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2465  peptidase S24 and S26 domain protein  40.34 
 
 		 139 aa  94  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000224053  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1670  DNA polymerase V subunit UmuD  40.34 
 
 		 139 aa  94  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267382  normal  0.982493 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1286  DNA polymerase V subunit UmuD  40.34 
 
 		 139 aa  94  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137402  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1328  DNA polymerase V subunit UmuD  40.34 
 
 		 139 aa  94  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143224  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01168  hypothetical protein  40.34 
 
 		 139 aa  94  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000352689  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2442  DNA polymerase V subunit UmuD  40.34 
 
 		 139 aa  94  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000116875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1340  DNA polymerase V subunit UmuD  40.34 
 
 		 139 aa  94  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000577771  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1966  DNA polymerase V subunit UmuD  39.5 
 
 		 139 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000484403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2605  peptidase S24/S26 domain-containing protein  42.24 
 
 		 140 aa  90.5  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.741198 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2213  DNA polymerase V subunit UmuD  41.53 
 
 		 139 aa  89.7  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0542538 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0037  protein ImpA  42.02 
 
 		 145 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0603297 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1907  putative prophage repressor  40.34 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1201  SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediated autopeptidase)-like  34.11 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0919  peptidase S24 and S26 domain protein  34.15 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.391106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2201  peptidase S24 and S26 domain protein  36.29 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1669  hypothetical protein  34.07 
 
 		 138 aa  81.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1663  hypothetical protein  34.07 
 
 		 138 aa  81.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0885  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  36 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1549  SOS mutagenesis protein UmuD  39.5 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.093809 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10191  putative SOS mutagenesis protein UmuD  47.44 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2352  putative prophage repressor  36.07 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2341  putative prophage repressor  36.07 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0052  mutagenesis and repair protein MucA  40.34 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2457  peptidase S24/S26 domain-containing protein  36.07 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2006  peptidase S24 and S26 domain protein  36.07 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362452 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0863  SOS mutagenesis protein UmuD  47.44 
 
 		 138 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0265877  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2105  SOS mutagenesis protein UmuD  47.44 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.499933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4001  putative prophage repressor  40.83 
 
 		 142 aa  78.2  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1278  putative prophage repressor  38.52 
 
 		 142 aa  77.8  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.824294  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09241  putative SOS mutagenesis protein UmuD  47.44 
 
 		 138 aa  77.8  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1337  umuD protein  33.61 
 
 		 141 aa  77  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16001  putative SOS mutagenesis protein UmuD  48.15 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1435  peptidase S24 and S26 domain protein  35.71 
 
 		 150 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2081  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.22 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0527419 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1208  putative prophage repressor  35.48 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00934288  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09221  putative SOS mutagenesis protein UmuD  47.44 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00588824  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0458  putative prophage repressor  35.29 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0671085  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4342  putative prophage repressor  38.64 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1291  putative SOS mutagenesis protein UmuD  45.68 
 
 		 147 aa  74.3  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172985  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1491  SOS mutagenesis protein UmuD  34.75 
 
 		 142 aa  74.7  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00671192  decreased coverage  0.0000906446 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1179  putative SOS mutagenesis protein UmuD  40.2 
 
 		 143 aa  73.6  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.482422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0858  putative prophage repressor  36.13 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4497  peptidase S24 and S26 domain protein  41.9 
 
 		 143 aa  73.6  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1368  peptidase S24 and S26 domain protein  33.6 
 
 		 150 aa  73.6  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.734123  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0275  SOS mutagenesis protein UmuD  43.59 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.121942  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09441  putative SOS mutagenesis protein UmuD  43.59 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.497301  normal  0.0831546 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1967  putative prophage repressor  41.77 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44891  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07081  putative SOS mutagenesis protein UmuD  36.97 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0803785 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1336  putative prophage repressor  36.44 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1039  hypothetical protein  31.75 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0056  hypothetical protein  31.75 
 
 		 168 aa  70.9  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.221897  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1004  hypothetical protein  31.75 
 
 		 168 aa  70.9  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2974  SOS mutagenesis protein UmuD  32.77 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.979623  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3076  SOS mutagenesis protein UmuD  33.6 
 
 		 139 aa  71.2  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1032  SOS mutagenesis protein UmuD  32.56 
 
 		 150 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0048  DNA polymerase V  36.84 
 
 		 137 aa  70.5  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109264 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0001  protein SamA  33.61 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0176  peptidase S24 and S26 domain protein  39 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3840  SOS mutagenesis protein UmuD  36.7 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0100  protein MucA  35 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.903241  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1370  SOS mutagenesis protein UmuD  46.67 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1981  putative prophage repressor  35.29 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0314  peptidase S24 and S26 domain protein  43.59 
 
 		 151 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1750  umuD protein  41.77 
 
 		 164 aa  67  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0221  peptidase S24 and S26 domain protein  37.63 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3751  peptidase S24/S26 domain-containing protein  38.46 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0340  peptidase S24 and S26 domain protein  42.31 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4320  peptidase S24 and S26 domain protein  38.83 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.381106 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2077  hypothetical protein  51.72 
 
 		 67 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10705e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0899  Peptidase S24, S26A and S26B, conserved region  42.86 
 
 		 148 aa  64.7  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4569  peptidase S24/S26 domain-containing protein  43.84 
 
 		 144 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0361  peptidase S24/S26 domain-containing protein  43.24 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.460438  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10663  SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediatedautopeptidase)-like protein  29.66 
 
 		 121 aa  62  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2061  peptidase S24 and S26 domain protein  35.06 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0332748  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4982  SOS mutagenesis protein UmuD  33.07 
 
 		 146 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.865075  unclonable  0.00000215009 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6256  peptidase S24/S26 domain-containing protein  37.5 
 
 		 150 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.836968 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2606  peptidase S24 and S26 domain protein  37.33 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.399777  normal  0.0172558 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0704  putative prophage repressor  31.54 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3941  peptidase S24 and S26 domain protein  35.63 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5031  putative prophage repressor  33.33 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916136  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2683  umuD protein  41.1 
 
 		 137 aa  54.7  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0640806  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2465  peptidase S24/S26 domain-containing protein  35.62 
 
 		 142 aa  54.3  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0134814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4594  SOS-response transcriptional repressor LexA-like protein  50.98 
 
 		 75 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235187  normal  0.79718 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2195  putative prophage repressor  33.68 
 
 		 274 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.543722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2762  peptidase S24, S26A and S26B  31.71 
 
 		 143 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0232979 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1287  hypothetical protein  70.59 
 
 		 88 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1018  domain of unknown function superfamily  70.59 
 
 		 89 aa  52.8  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1481  hypothetical protein  70.59 
 
 		 89 aa  52.4  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1963  putative prophage repressor  35.9 
 
 		 137 aa  51.6  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0559  peptidase S24 and S26 domain protein  34.48 
 
 		 171 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4173  putative prophage repressor  39.13 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0524637 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1649  hypothetical protein  67.65 
 
 		 82 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08270  DNA polymerase V subunit  35.62 
 
 		 135 aa  51.2  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>