61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B4790 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4790  phage tail tape measure protein, family  100 
 
 
877 aa  1774    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3313  TP901 family phage tail tape measure protein  41.18 
 
 
863 aa  464  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219365  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1357  phage tail-like protein  43.67 
 
 
550 aa  429  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37360  Phage TMP domain-containing protein  40.8 
 
 
1078 aa  422  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2589  TP901 family phage tail tape measure protein  40.08 
 
 
596 aa  354  5e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0411901 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2844  phage tail tape measure protein  29.23 
 
 
935 aa  274  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.581537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3027  phage tail tape measure protein  29.03 
 
 
935 aa  269  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000444183 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2622  TP901 family phage tail tape measure protein  30.18 
 
 
945 aa  247  6e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14845  hitchhiker  0.00000014123 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2588  TP901 family phage tail tape measure protein  30.18 
 
 
945 aa  247  6e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217501  hitchhiker  0.000000261263 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2489  phage tail tape measure protein  31.57 
 
 
1025 aa  227  8e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2753  TP901 family phage tail tape measure protein  31.01 
 
 
1025 aa  219  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000729903 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0946  phage tail tape measure protein  31.01 
 
 
1025 aa  217  8e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2350  TP901 family phage tail tape measure protein  25.67 
 
 
971 aa  172  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.5162  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2303  TP901 family phage tail tape measure protein  24.95 
 
 
971 aa  171  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.841337  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0859  TP901 family phage tail tape measure protein  38.52 
 
 
701 aa  166  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0227343  hitchhiker  0.00167683 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1375  Phage tail tape measure protein TP901, core region  25.88 
 
 
877 aa  162  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3658  phage tail tape measure protein, TP901 family  29.66 
 
 
733 aa  155  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3196  phage tail tape measure protein, TP901 family  25.1 
 
 
959 aa  145  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.112717  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4860  putative phage-related tail transmembrane protein  24.08 
 
 
920 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582054  normal  0.698632 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01340  phage-related tail protein  22.95 
 
 
956 aa  96.3  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.776722  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1155  TP901 family phage tail tape measure protein  21.89 
 
 
739 aa  95.5  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2893  phage tail tape measure protein, TP901 family  27.4 
 
 
817 aa  92  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.772057  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3478  TP901 family phage tail tape measure protein  22.98 
 
 
809 aa  91.7  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.790573  normal  0.139413 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1914  phage-related tail transmembrane protein  32.79 
 
 
887 aa  88.2  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.575173  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3026  phage tail tape measure protein, TP901 family  22.73 
 
 
815 aa  85.9  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0149182 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1133  hypothetical protein  21.58 
 
 
739 aa  85.5  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0394  hypothetical protein  21.58 
 
 
739 aa  85.5  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4349  TP901 family phage tail tape measure protein  30.69 
 
 
815 aa  84.7  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0181  putative phage-related tail transmembrane protein  25.83 
 
 
919 aa  84.3  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4387  gp24  30.12 
 
 
813 aa  84  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0182 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1327  phage-related tail transmembrane protein  26.67 
 
 
986 aa  80.9  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0698  Phage tail tape measure protein TP901, core region  22.55 
 
 
760 aa  79  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1569  phage tail tape measure protein, TP901 family  26.06 
 
 
825 aa  77  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258062  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0993  hypothetical protein  29.64 
 
 
361 aa  77.4  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.600478  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4465  putative phage tail protein  22.89 
 
 
784 aa  73.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4550  putative phage tail protein  22.56 
 
 
784 aa  71.6  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.423372  normal  0.711096 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4549  putative phage tail protein  22.57 
 
 
784 aa  70.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30814  normal  0.374859 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2914  prophage MuMc02, TP901 family tail tape measure protein  35.9 
 
 
993 aa  69.7  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4911  TP901 family phage tail tape measure protein  21.72 
 
 
814 aa  70.1  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2586  TP901 family phage tail tape measure protein  23.07 
 
 
1346 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2248  putative prophage LambdaBa02, tape measure protein  22.78 
 
 
1671 aa  63.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0144482  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2752  TP901 family phage tail tape measure protein  26.22 
 
 
598 aa  58.5  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.511781 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4082  prophage LambdaBa02, tape measure protein  22.47 
 
 
959 aa  58.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3793  prophage LambdaBa02, tape measure protein  22.47 
 
 
959 aa  58.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3322  Phage tail tape measure protein TP901, core region  23.58 
 
 
743 aa  57.4  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  25.94 
 
 
598 aa  56.2  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131361  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01999  hypothetical protein  23.91 
 
 
997 aa  56.2  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  28.41 
 
 
1216 aa  54.3  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1281  hypothetical protein  25.11 
 
 
824 aa  53.9  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_002978  WD0570  prophage P2W3, tail tape measure protein  21.74 
 
 
680 aa  51.2  0.00008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1215  TP901 family phage tail tape measure protein  21.5 
 
 
1030 aa  49.7  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1488  TP901 family phage tail tape measure protein  23.35 
 
 
781 aa  48.5  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0364  hypothetical protein  22.69 
 
 
989 aa  47.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0355  Phage-related protein-like protein  22.69 
 
 
989 aa  47.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0477  prophage LambdaBa04, tape measure protein  22.44 
 
 
1311 aa  47.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4592  Phage tail tape measure protein TP901, core region  26.43 
 
 
719 aa  47.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0454  prophage LambdaBa04, tape measure protein  22.44 
 
 
1311 aa  47.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0868  phage tail tape measure protein, TP901 family  26.94 
 
 
981 aa  47.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4487  TP901 family phage tail tape measure protein  25.93 
 
 
666 aa  45.4  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108183  normal  0.0686634 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1175  phage tail tape measure protein, TP901 family  23.62 
 
 
1343 aa  45.1  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4374  phage tail tape measure protein, family, core region  20.74 
 
 
1549 aa  44.7  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>