75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3073 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3073  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  511  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0238375  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3389  hypothetical protein  70.12 
 
 		 251 aa  370  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00215189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0462  hypothetical protein  68.53 
 
 		 250 aa  368  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00130481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3679  hypothetical protein  66.93 
 
 		 250 aa  362  4e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0284056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3504  hypothetical protein  66.93 
 
 		 250 aa  362  4e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000183633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3402  hypothetical protein  69.72 
 
 		 250 aa  360  1e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0448  hypothetical protein  66.53 
 
 		 250 aa  360  2e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00784696  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4131  hypothetical protein  65.34 
 
 		 250 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4508  hypothetical protein  64.94 
 
 		 250 aa  355  5e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0544  hypothetical protein  66.14 
 
 		 250 aa  354  7.999999999999999e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000326106  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0489  hypothetical protein  65.74 
 
 		 250 aa  353  2e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000981799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0468  hypothetical protein  65.74 
 
 		 250 aa  352  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000281501  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3851  hypothetical protein  65.34 
 
 		 250 aa  350  8.999999999999999e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0452291  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0492  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  64.94 
 
 		 250 aa  349  3e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000160917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0413  hypothetical protein  65.34 
 
 		 250 aa  343  1e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.977542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0461  hypothetical protein  62.95 
 
 		 250 aa  342  5e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1698  hypothetical protein  48.3 
 
 		 261 aa  226  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3618  hypothetical protein  49.6 
 
 		 260 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.115342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1576  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  48.41 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475006  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4293  hypothetical protein  48.41 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0245  hypothetical protein  45.15 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02060  hypothetical protein  45.15 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520939  normal  0.571612 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3856  hypothetical protein  47.22 
 
 		 260 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00178481  normal  0.564772 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1804  hypothetical protein  48.37 
 
 		 261 aa  208  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0626239  normal  0.487257 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1577  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  45.93 
 
 		 261 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4291  hypothetical protein  45.93 
 
 		 261 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3671  hypothetical protein  47.97 
 
 		 261 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3855  hypothetical protein  46.15 
 
 		 284 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0979699  normal  0.713498 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1700  hypothetical protein  44.84 
 
 		 261 aa  204  8e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3617  hypothetical protein  45.93 
 
 		 261 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0375428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2592  nucleoside-binding outer membrane protein  43.35 
 
 		 268 aa  194  9e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.416008 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3697  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  43.65 
 
 		 266 aa  193  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3214  hypothetical protein  41.7 
 
 		 268 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2763  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  38.25 
 
 		 286 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251865  normal  0.794833 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3976  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  39.06 
 
 		 262 aa  149  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000541292 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4054  hypothetical protein  36.8 
 
 		 242 aa  146  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3888  hypothetical protein  37.77 
 
 		 262 aa  142  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00561363  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0704  hypothetical protein  36.54 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1461  hypothetical protein  33.33 
 
 		 242 aa  125  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0083992  normal  0.0205194 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4879  hypothetical protein  32.47 
 
 		 275 aa  102  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000399602  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0194  hypothetical protein  35.96 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.7975  normal  0.0633994 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0198  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  33.97 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0187  hypothetical protein  33.01 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0177  hypothetical protein  33.01 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.713561  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01608  hypothetical protein  27 
 
 		 259 aa  68.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1024  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  27.84 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000282973  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3573  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  27.14 
 
 		 286 aa  52.8  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.772906  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0870  hypothetical protein  26.74 
 
 		 304 aa  52.4  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6735  hypothetical protein  22.13 
 
 		 286 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0854  hypothetical protein  25.52 
 
 		 314 aa  50.4  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0802  hypothetical protein  24.32 
 
 		 286 aa  50.4  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0110  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  33.05 
 
 		 289 aa  50.4  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3759  Nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx-like protein  27.27 
 
 		 270 aa  49.3  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6604  hypothetical protein  28.45 
 
 		 260 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.156691 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1228  hypothetical protein  28.45 
 
 		 260 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2816  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  27.35 
 
 		 277 aa  47.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000631711  unclonable  0.00000283394 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1215  outer membrane protein OmpK, putative  30.28 
 
 		 283 aa  47.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002697  outer membrane protein OmpK  33.33 
 
 		 272 aa  47  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.302081  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3228  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  27.14 
 
 		 301 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000169174  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1001  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  28.33 
 
 		 279 aa  47  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000919402  n/a   
 
 
 
NC_009831  Ssed_3379  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  28.46 
 
 		 278 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000573921  hitchhiker  0.00247146 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1040  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  29.91 
 
 		 279 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000125932  unclonable  0.0000000000727651 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3454  hypothetical protein  33.63 
 
 		 274 aa  44.7  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0269965 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1036  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  29.06 
 
 		 279 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000103481  unclonable  0.0000000000147865 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0879  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  25.5 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1101  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  29.06 
 
 		 279 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000152935  unclonable  0.0000213544 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0640  hypothetical protein  24.26 
 
 		 295 aa  44.3  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3550  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  28.57 
 
 		 277 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000115802  decreased coverage  0.000000668539 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1139  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  28.21 
 
 		 283 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567301  unclonable  0.00000000000471998 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3231  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  28.37 
 
 		 285 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000002039  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02890  hypothetical protein  35.71 
 
 		 277 aa  42.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.585077  hitchhiker  0.00223005 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2823  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  27.22 
 
 		 279 aa  42  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000597906  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0320  hypothetical protein  35.71 
 
 		 277 aa  42  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1772  hypothetical protein  26.84 
 
 		 284 aa  42  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.807545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01770  putative nucleoside-binding outer membrane protein  26.22 
 
 		 282 aa  42  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0718  normal  0.572812 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>