41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6735 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6735  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  584  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2592  nucleoside-binding outer membrane protein  21.95 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.416008 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4508  hypothetical protein  23.5 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3888  hypothetical protein  27.63 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00561363  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3976  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  28.07 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000541292 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0462  hypothetical protein  22.31 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00130481  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3214  hypothetical protein  22.78 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0198  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  27.31 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0245  hypothetical protein  23.33 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0177  hypothetical protein  26.87 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.713561  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02060  hypothetical protein  23.33 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520939  normal  0.571612 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0187  hypothetical protein  26.87 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1461  hypothetical protein  25.56 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0083992  normal  0.0205194 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3504  hypothetical protein  24.55 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000183633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3679  hypothetical protein  24.55 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0284056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0461  hypothetical protein  22.22 
 
 		 250 aa  54.7  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0448  hypothetical protein  24.09 
 
 		 250 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00784696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3389  hypothetical protein  20.94 
 
 		 251 aa  53.9  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00215189  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4131  hypothetical protein  24.09 
 
 		 250 aa  53.9  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3856  hypothetical protein  23.22 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00178481  normal  0.564772 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0194  hypothetical protein  24.56 
 
 		 278 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.7975  normal  0.0633994 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3073  hypothetical protein  22.37 
 
 		 251 aa  51.6  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0238375  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1804  hypothetical protein  23.47 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0626239  normal  0.487257 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3671  hypothetical protein  23.7 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3618  hypothetical protein  23.79 
 
 		 260 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.115342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1576  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  23.3 
 
 		 260 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475006  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4293  hypothetical protein  23.3 
 
 		 260 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0544  hypothetical protein  23.18 
 
 		 250 aa  50.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000326106  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1698  hypothetical protein  22.38 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0492  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  22.27 
 
 		 250 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000160917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1577  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  19.74 
 
 		 261 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4291  hypothetical protein  19.74 
 
 		 261 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0489  hypothetical protein  22.27 
 
 		 250 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000981799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1700  hypothetical protein  20.35 
 
 		 261 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0468  hypothetical protein  22.27 
 
 		 250 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000281501  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3855  hypothetical protein  20.35 
 
 		 284 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0979699  normal  0.713498 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4054  hypothetical protein  23.08 
 
 		 242 aa  44.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3617  hypothetical protein  20.66 
 
 		 261 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0375428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3851  hypothetical protein  22.07 
 
 		 250 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0452291  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3402  hypothetical protein  22.03 
 
 		 250 aa  43.5  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0413  hypothetical protein  21.62 
 
 		 250 aa  42.4  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.977542  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>