56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3214 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3214  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2592  nucleoside-binding outer membrane protein  83.96 
 
 		 268 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.416008 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0245  hypothetical protein  53.79 
 
 		 278 aa  276  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02060  hypothetical protein  53.79 
 
 		 278 aa  276  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520939  normal  0.571612 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3697  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  54.47 
 
 		 266 aa  269  4e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3618  hypothetical protein  53.94 
 
 		 260 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.115342  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4293  hypothetical protein  51.97 
 
 		 260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1576  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  51.97 
 
 		 260 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475006  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3671  hypothetical protein  52.34 
 
 		 261 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1698  hypothetical protein  53.15 
 
 		 261 aa  250  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1804  hypothetical protein  52.24 
 
 		 261 aa  248  7e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0626239  normal  0.487257 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3856  hypothetical protein  51.57 
 
 		 260 aa  248  8e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00178481  normal  0.564772 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4291  hypothetical protein  52.67 
 
 		 261 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1577  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  52.67 
 
 		 261 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3617  hypothetical protein  52.87 
 
 		 261 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0375428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1700  hypothetical protein  50 
 
 		 261 aa  244  8e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3855  hypothetical protein  51.85 
 
 		 284 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0979699  normal  0.713498 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3073  hypothetical protein  41.83 
 
 		 251 aa  175  7e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0238375  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0462  hypothetical protein  39.39 
 
 		 250 aa  172  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00130481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3389  hypothetical protein  40.38 
 
 		 251 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00215189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0461  hypothetical protein  37.69 
 
 		 250 aa  166  5e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0413  hypothetical protein  39.85 
 
 		 250 aa  161  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.977542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4508  hypothetical protein  37.21 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0489  hypothetical protein  37.84 
 
 		 250 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000981799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0544  hypothetical protein  38.76 
 
 		 250 aa  157  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000326106  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3851  hypothetical protein  37.84 
 
 		 250 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0452291  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4054  hypothetical protein  39 
 
 		 242 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0468  hypothetical protein  37.84 
 
 		 250 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000281501  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3402  hypothetical protein  37.93 
 
 		 250 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0492  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  37.84 
 
 		 250 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000160917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0448  hypothetical protein  36.82 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00784696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3504  hypothetical protein  36.82 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000183633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3679  hypothetical protein  36.82 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0284056  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4131  hypothetical protein  36.43 
 
 		 250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2763  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  36.68 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251865  normal  0.794833 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3976  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  36.05 
 
 		 262 aa  126  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000541292 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3888  hypothetical protein  35.62 
 
 		 262 aa  122  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00561363  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1461  hypothetical protein  31.97 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0083992  normal  0.0205194 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0704  hypothetical protein  31.09 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4879  hypothetical protein  30.91 
 
 		 275 aa  105  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000399602  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0870  hypothetical protein  29.96 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0854  hypothetical protein  29.39 
 
 		 314 aa  90.5  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0194  hypothetical protein  31.82 
 
 		 278 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.7975  normal  0.0633994 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01608  hypothetical protein  26.84 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0802  hypothetical protein  27.08 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0640  hypothetical protein  24.6 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0198  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  27.41 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6735  hypothetical protein  22.78 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1228  hypothetical protein  30 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0187  hypothetical protein  26.9 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0177  hypothetical protein  26.9 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.713561  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6604  hypothetical protein  30 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.156691 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02890  hypothetical protein  23.66 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.585077  hitchhiker  0.00223005 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1772  hypothetical protein  23.32 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.807545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3454  hypothetical protein  25.6 
 
 		 274 aa  54.7  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0269965 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0320  hypothetical protein  23.85 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>