46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0870 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0870  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  628  1e-179  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0854  hypothetical protein  94.83 
 
 		 314 aa  565  1e-160  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0802  hypothetical protein  59.41 
 
 		 286 aa  308  5e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0640  hypothetical protein  40.96 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3454  hypothetical protein  40.14 
 
 		 274 aa  167  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0269965 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1772  hypothetical protein  35.94 
 
 		 284 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.807545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0320  hypothetical protein  35.29 
 
 		 277 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02890  hypothetical protein  33.8 
 
 		 277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.585077  hitchhiker  0.00223005 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2143  putative signal peptide  34.74 
 
 		 339 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00697757  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4345  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  33.69 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1696  putative signal peptide  29.73 
 
 		 331 aa  119  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109221  normal  0.128505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2015  putative signal peptide  29.73 
 
 		 331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.46412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1122  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  30.54 
 
 		 331 aa  117  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6201  putative signal peptide  32.22 
 
 		 338 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.224106 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4806  putative signal peptide  30.32 
 
 		 371 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.974296  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2592  nucleoside-binding outer membrane protein  28.99 
 
 		 268 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.416008 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4879  hypothetical protein  28.03 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000399602  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3214  hypothetical protein  29.96 
 
 		 268 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1700  hypothetical protein  25.68 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3856  hypothetical protein  25 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00178481  normal  0.564772 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3618  hypothetical protein  25.93 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.115342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3855  hypothetical protein  26.77 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0979699  normal  0.713498 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3617  hypothetical protein  24.81 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0375428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3888  hypothetical protein  27.71 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00561363  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3976  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  27.53 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000541292 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4291  hypothetical protein  25.37 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1577  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  25.37 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1576  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  24.24 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475006  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4293  hypothetical protein  24.24 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1804  hypothetical protein  24.38 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0626239  normal  0.487257 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3671  hypothetical protein  23.83 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1698  hypothetical protein  24.44 
 
 		 261 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425272  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4054  hypothetical protein  26.49 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3697  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  26.97 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2061  hypothetical protein  26.24 
 
 		 364 aa  63.5  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.377707 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02060  hypothetical protein  22.92 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520939  normal  0.571612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0245  hypothetical protein  22.92 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01608  hypothetical protein  26.02 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2064  hypothetical protein  26.36 
 
 		 364 aa  60.5  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal  0.204631 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2763  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  23.69 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251865  normal  0.794833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2062  hypothetical protein  25.1 
 
 		 364 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335089  normal  0.204631 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0413  hypothetical protein  24.03 
 
 		 250 aa  50.4  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.977542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1461  hypothetical protein  23.47 
 
 		 242 aa  49.3  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0083992  normal  0.0205194 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3073  hypothetical protein  26.18 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0238375  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0461  hypothetical protein  27.81 
 
 		 250 aa  43.9  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0704  hypothetical protein  22.3 
 
 		 256 aa  43.1  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>