47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0320 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0320  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02890  hypothetical protein  98.56 
 
 		 277 aa  565  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.585077  hitchhiker  0.00223005 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1772  hypothetical protein  45.91 
 
 		 284 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.807545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0640  hypothetical protein  43.12 
 
 		 295 aa  201  8e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0802  hypothetical protein  38.83 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0870  hypothetical protein  35.21 
 
 		 304 aa  155  8e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0854  hypothetical protein  34.48 
 
 		 314 aa  155  9e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3454  hypothetical protein  33.21 
 
 		 274 aa  135  7.000000000000001e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0269965 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6201  putative signal peptide  32.77 
 
 		 338 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.224106 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2143  putative signal peptide  31.91 
 
 		 339 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00697757  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1696  putative signal peptide  31.2 
 
 		 331 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109221  normal  0.128505 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1122  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  31.2 
 
 		 331 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4345  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  32.89 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2015  putative signal peptide  31.2 
 
 		 331 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.46412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2064  hypothetical protein  27.44 
 
 		 364 aa  83.2  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal  0.204631 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4806  putative signal peptide  29.22 
 
 		 371 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.974296  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2061  hypothetical protein  27.34 
 
 		 364 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.377707 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1700  hypothetical protein  25.19 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2062  hypothetical protein  26.89 
 
 		 364 aa  80.5  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335089  normal  0.204631 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1698  hypothetical protein  25 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3618  hypothetical protein  25.54 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.115342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3856  hypothetical protein  24.56 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00178481  normal  0.564772 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4293  hypothetical protein  24.47 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1577  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  26.51 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1576  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  24.47 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475006  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4291  hypothetical protein  26.51 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3617  hypothetical protein  26.51 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0375428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3855  hypothetical protein  25.7 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0979699  normal  0.713498 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1804  hypothetical protein  22.61 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0626239  normal  0.487257 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4879  hypothetical protein  27.03 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000399602  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3671  hypothetical protein  22.86 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4054  hypothetical protein  23.22 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3214  hypothetical protein  23.66 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2592  nucleoside-binding outer membrane protein  25.86 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.416008 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01608  hypothetical protein  24.29 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2763  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  23.02 
 
 		 286 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251865  normal  0.794833 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1461  hypothetical protein  31.31 
 
 		 242 aa  53.9  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0083992  normal  0.0205194 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3888  hypothetical protein  21.52 
 
 		 262 aa  53.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00561363  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3976  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  21.94 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000541292 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3389  hypothetical protein  23.46 
 
 		 251 aa  53.1  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00215189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0461  hypothetical protein  22.69 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3697  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  21.4 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0413  hypothetical protein  23.08 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.977542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0198  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  25.96 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0187  hypothetical protein  25.53 
 
 		 265 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0177  hypothetical protein  25.53 
 
 		 265 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.713561  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3073  hypothetical protein  35.71 
 
 		 251 aa  42.4  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0238375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>