58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4508 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4508  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0462  hypothetical protein  80.4 
 
 		 250 aa  434  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00130481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0461  hypothetical protein  75.2 
 
 		 250 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3389  hypothetical protein  76 
 
 		 251 aa  410  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00215189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3679  hypothetical protein  70.4 
 
 		 250 aa  383  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0284056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0448  hypothetical protein  70 
 
 		 250 aa  381  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00784696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3504  hypothetical protein  70.4 
 
 		 250 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000183633  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4131  hypothetical protein  68.8 
 
 		 250 aa  375  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0413  hypothetical protein  66.4 
 
 		 250 aa  372  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.977542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0544  hypothetical protein  68.4 
 
 		 250 aa  373  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000326106  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3851  hypothetical protein  67.2 
 
 		 250 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0452291  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0489  hypothetical protein  67.2 
 
 		 250 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000981799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0468  hypothetical protein  66.8 
 
 		 250 aa  367  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000281501  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0492  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  66.4 
 
 		 250 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000160917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3073  hypothetical protein  66.1 
 
 		 251 aa  346  2e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0238375  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3402  hypothetical protein  64 
 
 		 250 aa  343  1e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1698  hypothetical protein  47.27 
 
 		 261 aa  214  8e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3618  hypothetical protein  46.36 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.115342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3856  hypothetical protein  45.21 
 
 		 260 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00178481  normal  0.564772 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1576  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  44.83 
 
 		 260 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1804  hypothetical protein  45.12 
 
 		 261 aa  206  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0626239  normal  0.487257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4293  hypothetical protein  45.31 
 
 		 260 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3671  hypothetical protein  44.72 
 
 		 261 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1700  hypothetical protein  42.75 
 
 		 261 aa  193  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1577  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  44.13 
 
 		 261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4291  hypothetical protein  44.13 
 
 		 261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3855  hypothetical protein  42.91 
 
 		 284 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0979699  normal  0.713498 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02060  hypothetical protein  42.62 
 
 		 278 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520939  normal  0.571612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0245  hypothetical protein  42.62 
 
 		 278 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3617  hypothetical protein  43.72 
 
 		 261 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0375428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3697  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  40.64 
 
 		 266 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2592  nucleoside-binding outer membrane protein  38.37 
 
 		 268 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.416008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3214  hypothetical protein  37.21 
 
 		 268 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2763  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  34.41 
 
 		 286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251865  normal  0.794833 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4054  hypothetical protein  35.04 
 
 		 242 aa  137  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3976  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  34.55 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000541292 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3888  hypothetical protein  34.15 
 
 		 262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00561363  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1461  hypothetical protein  29.44 
 
 		 242 aa  119  6e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0083992  normal  0.0205194 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0704  hypothetical protein  32.17 
 
 		 256 aa  108  6e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4879  hypothetical protein  29.07 
 
 		 275 aa  88.6  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000399602  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0194  hypothetical protein  31.9 
 
 		 278 aa  72  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.7975  normal  0.0633994 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6735  hypothetical protein  23.5 
 
 		 286 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0198  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  30.43 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0187  hypothetical protein  29.47 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0177  hypothetical protein  29.47 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.713561  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3573  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  27.02 
 
 		 286 aa  58.5  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.772906  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1024  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  24 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000282973  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01608  hypothetical protein  23.5 
 
 		 259 aa  53.1  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0802  hypothetical protein  24.31 
 
 		 286 aa  50.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3759  Nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx-like protein  25.31 
 
 		 270 aa  49.7  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1772  hypothetical protein  24.56 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.807545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2816  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  26.5 
 
 		 277 aa  46.6  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000631711  unclonable  0.00000283394 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1215  outer membrane protein OmpK, putative  28.57 
 
 		 283 aa  46.2  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002697  outer membrane protein OmpK  28.4 
 
 		 272 aa  44.7  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.302081  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0110  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  24.29 
 
 		 289 aa  42.4  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6604  hypothetical protein  29 
 
 		 260 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.156691 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1228  hypothetical protein  29 
 
 		 260 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0879  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  22.73 
 
 		 294 aa  42  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>