35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6604 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6604  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.156691 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1228  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3697  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  41.59 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3214  hypothetical protein  30 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4054  hypothetical protein  30.53 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0245  hypothetical protein  37.17 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02060  hypothetical protein  37.17 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520939  normal  0.571612 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1804  hypothetical protein  35.09 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0626239  normal  0.487257 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3888  hypothetical protein  25 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00561363  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3976  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  27.88 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000541292 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3671  hypothetical protein  34.82 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1698  hypothetical protein  34.82 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2592  nucleoside-binding outer membrane protein  28.74 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.416008 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3618  hypothetical protein  34.51 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.115342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3855  hypothetical protein  35.71 
 
 		 284 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0979699  normal  0.713498 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2763  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  30.4 
 
 		 286 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251865  normal  0.794833 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4293  hypothetical protein  33.63 
 
 		 260 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1576  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  33.63 
 
 		 260 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3617  hypothetical protein  33.04 
 
 		 261 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0375428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3856  hypothetical protein  34.51 
 
 		 260 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00178481  normal  0.564772 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1461  hypothetical protein  25.14 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0083992  normal  0.0205194 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4291  hypothetical protein  32.14 
 
 		 261 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1577  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  32.14 
 
 		 261 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1700  hypothetical protein  30.77 
 
 		 261 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3389  hypothetical protein  33.33 
 
 		 251 aa  49.3  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00215189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3073  hypothetical protein  28.45 
 
 		 251 aa  48.9  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0238375  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0462  hypothetical protein  29.7 
 
 		 250 aa  47  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00130481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0461  hypothetical protein  30.13 
 
 		 250 aa  47  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0413  hypothetical protein  34.78 
 
 		 250 aa  45.8  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.977542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0489  hypothetical protein  28.83 
 
 		 250 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000981799  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4131  hypothetical protein  35.82 
 
 		 250 aa  42.7  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0492  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  29.09 
 
 		 250 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000160917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3851  hypothetical protein  29.09 
 
 		 250 aa  42  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0452291  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3402  hypothetical protein  33.82 
 
 		 250 aa  42  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4508  hypothetical protein  29 
 
 		 250 aa  42  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237235  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>