63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1700 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1700  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1576  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  72.31 
 
 		 260 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475006  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4293  hypothetical protein  72.31 
 
 		 260 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3856  hypothetical protein  71.92 
 
 		 260 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00178481  normal  0.564772 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3618  hypothetical protein  71.92 
 
 		 260 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.115342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1698  hypothetical protein  70.88 
 
 		 261 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3855  hypothetical protein  74.79 
 
 		 284 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0979699  normal  0.713498 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3617  hypothetical protein  76.03 
 
 		 261 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0375428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1804  hypothetical protein  73.97 
 
 		 261 aa  388  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0626239  normal  0.487257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4291  hypothetical protein  74.38 
 
 		 261 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1577  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  74.38 
 
 		 261 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3671  hypothetical protein  73.14 
 
 		 261 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0245  hypothetical protein  60.43 
 
 		 278 aa  338  4e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02060  hypothetical protein  60.43 
 
 		 278 aa  338  4e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520939  normal  0.571612 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3697  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  63.89 
 
 		 266 aa  337  8e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2592  nucleoside-binding outer membrane protein  51.19 
 
 		 268 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.416008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3214  hypothetical protein  50 
 
 		 268 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0461  hypothetical protein  46.12 
 
 		 250 aa  208  8e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0462  hypothetical protein  46.03 
 
 		 250 aa  206  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00130481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3073  hypothetical protein  45.12 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0238375  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3389  hypothetical protein  44.66 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00215189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4508  hypothetical protein  42.75 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0489  hypothetical protein  42.25 
 
 		 250 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000981799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0492  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  42.25 
 
 		 250 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000160917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0448  hypothetical protein  42.64 
 
 		 250 aa  191  7e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00784696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0468  hypothetical protein  42.25 
 
 		 250 aa  191  7e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000281501  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3679  hypothetical protein  42.64 
 
 		 250 aa  191  7e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0284056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3504  hypothetical protein  42.64 
 
 		 250 aa  191  7e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000183633  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4131  hypothetical protein  42.8 
 
 		 250 aa  191  9e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3851  hypothetical protein  42.25 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0452291  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0413  hypothetical protein  43.8 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.977542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0544  hypothetical protein  41.86 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000326106  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3402  hypothetical protein  43.97 
 
 		 250 aa  185  7e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2763  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  41.79 
 
 		 286 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251865  normal  0.794833 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3976  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  39.92 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000541292 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3888  hypothetical protein  39.92 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00561363  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4054  hypothetical protein  36.1 
 
 		 242 aa  142  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0704  hypothetical protein  35.98 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1461  hypothetical protein  31.91 
 
 		 242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0083992  normal  0.0205194 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4879  hypothetical protein  33.33 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000399602  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01608  hypothetical protein  29.44 
 
 		 259 aa  87.8  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0870  hypothetical protein  25.68 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0854  hypothetical protein  25.53 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0194  hypothetical protein  32.04 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.7975  normal  0.0633994 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02890  hypothetical protein  25.78 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.585077  hitchhiker  0.00223005 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0320  hypothetical protein  25.51 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0640  hypothetical protein  24.3 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0198  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  29.39 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0187  hypothetical protein  29.39 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0177  hypothetical protein  29.39 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.713561  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0802  hypothetical protein  24.47 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1772  hypothetical protein  22.71 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.807545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3454  hypothetical protein  22.5 
 
 		 274 aa  54.7  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0269965 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1024  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  25.56 
 
 		 295 aa  50.4  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000282973  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1228  hypothetical protein  30.77 
 
 		 260 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6604  hypothetical protein  30.77 
 
 		 260 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.156691 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4806  putative signal peptide  22.81 
 
 		 371 aa  47  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.974296  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6735  hypothetical protein  20.35 
 
 		 286 aa  45.8  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2816  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  25.2 
 
 		 277 aa  45.8  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000631711  unclonable  0.00000283394 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002697  outer membrane protein OmpK  29.21 
 
 		 272 aa  43.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.302081  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1001  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  25.34 
 
 		 279 aa  42.4  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000919402  n/a   
 
 
 
NC_007963  Csal_0110  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  26.77 
 
 		 289 aa  42.4  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3231  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  25 
 
 		 285 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000002039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>