57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0198 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0198  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  100 
 
 		 265 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0187  hypothetical protein  98.49 
 
 		 265 aa  531  1e-150  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0177  hypothetical protein  98.49 
 
 		 265 aa  531  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.713561  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0194  hypothetical protein  57.37 
 
 		 278 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.7975  normal  0.0633994 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3888  hypothetical protein  34.5 
 
 		 262 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00561363  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3976  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  34.5 
 
 		 262 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000541292 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1461  hypothetical protein  28.09 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0083992  normal  0.0205194 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0245  hypothetical protein  32.14 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02060  hypothetical protein  32.14 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520939  normal  0.571612 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0492  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  30.15 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000160917  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3671  hypothetical protein  31.19 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3856  hypothetical protein  30.14 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00178481  normal  0.564772 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3504  hypothetical protein  30.53 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000183633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3679  hypothetical protein  30.53 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0284056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0489  hypothetical protein  29.77 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000981799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0544  hypothetical protein  29.89 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000326106  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3851  hypothetical protein  29.77 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0452291  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0468  hypothetical protein  29.77 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000281501  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3389  hypothetical protein  31.8 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00215189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1804  hypothetical protein  30.59 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0626239  normal  0.487257 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0448  hypothetical protein  30.15 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00784696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3073  hypothetical protein  34.13 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0238375  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4131  hypothetical protein  29.89 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3855  hypothetical protein  29.6 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0979699  normal  0.713498 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4293  hypothetical protein  28.36 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1576  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  29.68 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3617  hypothetical protein  30.32 
 
 		 261 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0375428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1700  hypothetical protein  29.5 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4291  hypothetical protein  28.7 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1577  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  28.7 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3402  hypothetical protein  31 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1698  hypothetical protein  30.53 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2592  nucleoside-binding outer membrane protein  27.78 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.416008 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0461  hypothetical protein  27.59 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3618  hypothetical protein  27.95 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.115342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0462  hypothetical protein  30 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00130481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4508  hypothetical protein  30.43 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0413  hypothetical protein  27.97 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.977542  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3214  hypothetical protein  27.41 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3697  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  34.18 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2763  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  28.03 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251865  normal  0.794833 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6735  hypothetical protein  27.31 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1772  hypothetical protein  28.08 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.807545  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4054  hypothetical protein  26.32 
 
 		 242 aa  54.3  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4879  hypothetical protein  24.56 
 
 		 275 aa  52.8  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000399602  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0640  hypothetical protein  29.55 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3454  hypothetical protein  25.75 
 
 		 274 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0269965 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1696  putative signal peptide  24.18 
 
 		 331 aa  47  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109221  normal  0.128505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2015  putative signal peptide  24.18 
 
 		 331 aa  47  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.46412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1122  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  24.18 
 
 		 331 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02890  hypothetical protein  26.07 
 
 		 277 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.585077  hitchhiker  0.00223005 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0704  hypothetical protein  26.26 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6201  putative signal peptide  22.76 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.224106 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01608  hypothetical protein  24.88 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0320  hypothetical protein  26.07 
 
 		 277 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0870  hypothetical protein  24.44 
 
 		 304 aa  42.7  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4806  putative signal peptide  24.22 
 
 		 371 aa  42.4  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.974296  normal  0.0595664 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>