66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0468 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0468  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000281501  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0489  hypothetical protein  99.6 
 
 		 250 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000981799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3851  hypothetical protein  98.4 
 
 		 250 aa  510  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0452291  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0492  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  98.4 
 
 		 250 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000160917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0544  hypothetical protein  96.4 
 
 		 250 aa  500  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000326106  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4131  hypothetical protein  94 
 
 		 250 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3679  hypothetical protein  94 
 
 		 250 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0284056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0448  hypothetical protein  94.4 
 
 		 250 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00784696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3504  hypothetical protein  94 
 
 		 250 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000183633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0413  hypothetical protein  73.2 
 
 		 250 aa  395  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.977542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3389  hypothetical protein  71.2 
 
 		 251 aa  389  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00215189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3402  hypothetical protein  73.2 
 
 		 250 aa  388  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0462  hypothetical protein  69.2 
 
 		 250 aa  379  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00130481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4508  hypothetical protein  66.8 
 
 		 250 aa  367  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0461  hypothetical protein  67.6 
 
 		 250 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3073  hypothetical protein  65.74 
 
 		 251 aa  345  4e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0238375  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1698  hypothetical protein  47.17 
 
 		 261 aa  223  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425272  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4293  hypothetical protein  46.36 
 
 		 260 aa  214  7e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1576  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  45.98 
 
 		 260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3618  hypothetical protein  45.98 
 
 		 260 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.115342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3856  hypothetical protein  44.06 
 
 		 260 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00178481  normal  0.564772 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1804  hypothetical protein  44.9 
 
 		 261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0626239  normal  0.487257 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1700  hypothetical protein  42.25 
 
 		 261 aa  191  6e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3671  hypothetical protein  44.08 
 
 		 261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3855  hypothetical protein  43.67 
 
 		 284 aa  188  8e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0979699  normal  0.713498 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1577  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  44.08 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4291  hypothetical protein  44.08 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3617  hypothetical protein  43.67 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0375428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0245  hypothetical protein  42.98 
 
 		 278 aa  184  8e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02060  hypothetical protein  42.98 
 
 		 278 aa  184  8e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520939  normal  0.571612 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3697  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  39.53 
 
 		 266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2592  nucleoside-binding outer membrane protein  38.37 
 
 		 268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.416008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3214  hypothetical protein  37.84 
 
 		 268 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2763  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  36.33 
 
 		 286 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251865  normal  0.794833 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4054  hypothetical protein  36.8 
 
 		 242 aa  136  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3976  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  35.66 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000541292 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3888  hypothetical protein  34.84 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00561363  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0704  hypothetical protein  33.86 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1461  hypothetical protein  28.28 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0083992  normal  0.0205194 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4879  hypothetical protein  29.39 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000399602  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0198  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  30.93 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0194  hypothetical protein  30.81 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.7975  normal  0.0633994 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0187  hypothetical protein  30.51 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0177  hypothetical protein  30.51 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.713561  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1024  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  25.86 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000282973  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1215  outer membrane protein OmpK, putative  29.05 
 
 		 283 aa  53.1  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2816  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  26.45 
 
 		 277 aa  50.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000631711  unclonable  0.00000283394 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01608  hypothetical protein  24.19 
 
 		 259 aa  50.4  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1001  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  25.57 
 
 		 279 aa  50.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000919402  n/a   
 
 
 
NC_013456  VEA_002697  outer membrane protein OmpK  31.5 
 
 		 272 aa  50.4  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.302081  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3228  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  25.69 
 
 		 301 aa  49.7  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000169174  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1040  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  25 
 
 		 279 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000125932  unclonable  0.0000000000727651 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1036  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  24.39 
 
 		 279 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000103481  unclonable  0.0000000000147865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1101  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  24.39 
 
 		 279 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000152935  unclonable  0.0000213544 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03287  hypothetical protein  24.78 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3573  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  25.5 
 
 		 286 aa  47  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.772906  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3231  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  24.51 
 
 		 285 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000002039  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6735  hypothetical protein  22.27 
 
 		 286 aa  45.8  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3367  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  23.67 
 
 		 289 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000101971  hitchhiker  0.00176833 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2823  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  24.75 
 
 		 279 aa  45.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000597906  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0879  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  24.53 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3550  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  27.5 
 
 		 277 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000115802  decreased coverage  0.000000668539 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2072  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  28.1 
 
 		 293 aa  43.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1139  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  23.76 
 
 		 283 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567301  unclonable  0.00000000000471998 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3379  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  23.71 
 
 		 278 aa  42.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000573921  hitchhiker  0.00247146 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3759  Nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx-like protein  23.77 
 
 		 270 aa  42  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>