60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4879 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4879  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  558  1e-158  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000399602  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01608  hypothetical protein  44.02 
 
 		 259 aa  189  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1804  hypothetical protein  35.4 
 
 		 261 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0626239  normal  0.487257 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3671  hypothetical protein  35.4 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3856  hypothetical protein  34.12 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00178481  normal  0.564772 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3618  hypothetical protein  33.33 
 
 		 260 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.115342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3697  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  33.63 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02060  hypothetical protein  30.43 
 
 		 278 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520939  normal  0.571612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0245  hypothetical protein  30.43 
 
 		 278 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1576  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  33.96 
 
 		 260 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475006  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4293  hypothetical protein  33.96 
 
 		 260 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1700  hypothetical protein  33.33 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3214  hypothetical protein  30.91 
 
 		 268 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3855  hypothetical protein  32.52 
 
 		 284 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0979699  normal  0.713498 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4054  hypothetical protein  29.45 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4291  hypothetical protein  32.52 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1577  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  32.52 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3617  hypothetical protein  32.52 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0375428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3073  hypothetical protein  32.47 
 
 		 251 aa  102  9e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0238375  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1698  hypothetical protein  30.87 
 
 		 261 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2592  nucleoside-binding outer membrane protein  28.21 
 
 		 268 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.416008 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0461  hypothetical protein  31.88 
 
 		 250 aa  95.1  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3976  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  29.57 
 
 		 262 aa  92  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000541292 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0870  hypothetical protein  28.03 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3454  hypothetical protein  26.67 
 
 		 274 aa  90.1  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0269965 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3888  hypothetical protein  28.79 
 
 		 262 aa  90.1  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00561363  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0462  hypothetical protein  29.13 
 
 		 250 aa  89  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00130481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4508  hypothetical protein  29.07 
 
 		 250 aa  88.6  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0854  hypothetical protein  27.2 
 
 		 314 aa  87.4  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3389  hypothetical protein  30.6 
 
 		 251 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00215189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0413  hypothetical protein  28.37 
 
 		 250 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.977542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0640  hypothetical protein  23.9 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3851  hypothetical protein  29.57 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0452291  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0544  hypothetical protein  29.82 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000326106  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0489  hypothetical protein  29.39 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000981799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0492  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  29.57 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000160917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1772  hypothetical protein  22.96 
 
 		 284 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.807545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0468  hypothetical protein  29.39 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000281501  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3402  hypothetical protein  32.31 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3679  hypothetical protein  29.39 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0284056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3504  hypothetical protein  29.39 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000183633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2763  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  29.18 
 
 		 286 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251865  normal  0.794833 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0448  hypothetical protein  29.2 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00784696  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4131  hypothetical protein  29.82 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0194  hypothetical protein  30.09 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.7975  normal  0.0633994 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0802  hypothetical protein  29.03 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1461  hypothetical protein  27.39 
 
 		 242 aa  68.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0083992  normal  0.0205194 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02890  hypothetical protein  27.03 
 
 		 277 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.585077  hitchhiker  0.00223005 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0320  hypothetical protein  27.03 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0704  hypothetical protein  25.65 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2015  putative signal peptide  25.93 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.46412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1696  putative signal peptide  25.93 
 
 		 331 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109221  normal  0.128505 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1122  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  25.21 
 
 		 331 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6201  putative signal peptide  24.81 
 
 		 338 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.224106 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2143  putative signal peptide  22.75 
 
 		 339 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00697757  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0187  hypothetical protein  25.44 
 
 		 265 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0177  hypothetical protein  25.22 
 
 		 265 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.713561  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0198  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  25.88 
 
 		 265 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4345  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  26.41 
 
 		 323 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4806  putative signal peptide  24.6 
 
 		 371 aa  47  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.974296  normal  0.0595664 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>