70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1036 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1101  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  100 
 
 		 279 aa  565  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000152935  unclonable  0.0000213544 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1036  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  100 
 
 		 279 aa  565  1e-160  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000103481  unclonable  0.0000000000147865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1040  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  98.21 
 
 		 279 aa  560  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000125932  unclonable  0.0000000000727651 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2823  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  96.42 
 
 		 279 aa  528  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000597906  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1001  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  91.76 
 
 		 279 aa  525  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000919402  n/a   
 
 
 
NC_011663  Sbal223_1139  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  92.11 
 
 		 283 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567301  unclonable  0.00000000000471998 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3231  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  88.46 
 
 		 285 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000002039  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3367  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  87.03 
 
 		 289 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000101971  hitchhiker  0.00176833 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2816  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  76.51 
 
 		 277 aa  396  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000631711  unclonable  0.00000283394 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3550  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  69.53 
 
 		 277 aa  374  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000115802  decreased coverage  0.000000668539 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1215  outer membrane protein OmpK, putative  68.88 
 
 		 283 aa  369  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3379  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  69.86 
 
 		 278 aa  365  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000573921  hitchhiker  0.00247146 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1024  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  65.89 
 
 		 295 aa  362  4e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000282973  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3228  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  65.57 
 
 		 301 aa  358  7e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000169174  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3049  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  67.01 
 
 		 287 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000184608  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03287  hypothetical protein  59.62 
 
 		 273 aa  298  5e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1893  nucleoside-specific channel-forming protein  59.4 
 
 		 296 aa  295  5e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002697  outer membrane protein OmpK  59.25 
 
 		 272 aa  293  3e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.302081  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0110  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  42.86 
 
 		 289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01770  putative nucleoside-binding outer membrane protein  36.75 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0718  normal  0.572812 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3858  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  28 
 
 		 319 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.297258 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4122  nucleoside-specific channel-forming protein  29.84 
 
 		 304 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3757  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  29.66 
 
 		 319 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2072  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  32.64 
 
 		 293 aa  90.1  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0471  nucleoside-specific channel-forming protein tsx  31.78 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0629  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  29.79 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0459  nucleoside-specific channel-forming protein tsx  31.78 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0668  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  30.27 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0451  nucleoside-specific channel-forming protein tsx  31.78 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0513  nucleoside-specific channel-forming protein tsx  31.78 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0453  nucleoside-specific channel-forming protein tsx  31.78 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0442  nucleoside-specific channel-forming protein  34.71 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0482  nucleoside-specific channel-forming protein  34.71 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0445  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  34.71 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3222  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  34.71 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.904335  hitchhiker  0.00000141914 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0493  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  34.71 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.521942  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3198  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  34.71 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0134636  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00363  hypothetical protein  34.71 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.502644  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00359  nucleoside channel, receptor of phage T6 and colicin K  34.71 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.527354  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0879  nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx  38.41 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0332  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  34.3 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.188825  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3573  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  29.15 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.772906  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4384  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  29.29 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.605519 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3759  Nucleoside-specific channel-forming protein, Tsx-like protein  30.96 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1577  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  25.35 
 
 		 261 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3402  hypothetical protein  26.73 
 
 		 250 aa  50.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4291  hypothetical protein  25.35 
 
 		 261 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0544  hypothetical protein  25.45 
 
 		 250 aa  49.7  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000326106  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4054  hypothetical protein  24.31 
 
 		 242 aa  49.7  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4131  hypothetical protein  26.48 
 
 		 250 aa  49.3  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2763  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  28.77 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251865  normal  0.794833 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0489  hypothetical protein  24.55 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000981799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3851  hypothetical protein  24.55 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0452291  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3504  hypothetical protein  26.27 
 
 		 250 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000183633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3679  hypothetical protein  26.27 
 
 		 250 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0284056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0448  hypothetical protein  26.27 
 
 		 250 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00784696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0468  hypothetical protein  24.55 
 
 		 250 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000281501  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0492  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  24.55 
 
 		 250 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000160917  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3976  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  30.71 
 
 		 262 aa  46.6  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000541292 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3855  hypothetical protein  23.94 
 
 		 284 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0979699  normal  0.713498 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0461  hypothetical protein  25.45 
 
 		 250 aa  45.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3073  hypothetical protein  29.06 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0238375  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0245  hypothetical protein  25.73 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3888  hypothetical protein  29.92 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00561363  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02060  hypothetical protein  25.73 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520939  normal  0.571612 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0194  hypothetical protein  31.54 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.7975  normal  0.0633994 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0413  hypothetical protein  25 
 
 		 250 aa  43.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.977542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3617  hypothetical protein  27.96 
 
 		 261 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0375428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3697  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  27.78 
 
 		 266 aa  42.7  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0462  hypothetical protein  25 
 
 		 250 aa  42.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00130481  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>