More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2512 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2512  hypothetical protein  100 
 
 		 406 aa  832    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2459  metal dependent phosphohydrolase  62.69 
 
 		 400 aa  526  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1740  metal dependent phosphohydrolase  56.3 
 
 		 401 aa  475  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0020457  hitchhiker  0.000000139322 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2375  metal dependent phosphohydrolase  57.78 
 
 		 407 aa  474  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000143917  unclonable  0.000001487 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2362  metal dependent phosphohydrolase  56.9 
 
 		 402 aa  472  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.014285  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1577  metal dependent phosphohydrolase  56.93 
 
 		 401 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1571  metal dependent phosphohydrolase  57.04 
 
 		 401 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000899891 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1510  metal dependent phosphohydrolase  56.44 
 
 		 401 aa  461  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.933649  hitchhiker  0.00011733 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2862  HDIG domain-containing protein  57.18 
 
 		 401 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1707  metal dependent phosphohydrolase  56.19 
 
 		 401 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.336199  hitchhiker  0.00000000228232 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2677  metal dependent phosphohydrolase  56.19 
 
 		 401 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0495903  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2756  metal dependent phosphohydrolase  56.19 
 
 		 401 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2642  metal dependent phosphohydrolase  56.44 
 
 		 401 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1519  putative metal dependent phosphohydrolase  54.46 
 
 		 404 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000671855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2844  metal dependent phosphohydrolase  53.81 
 
 		 404 aa  451  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000021567 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1691  metal dependent phosphohydrolase  53.09 
 
 		 398 aa  441  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0771353  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1724  metal dependent phosphohydrolase  32.53 
 
 		 419 aa  229  6e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2351  metal dependent phosphohydrolase  30.98 
 
 		 421 aa  209  8e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0796971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2078  hypothetical protein  32.26 
 
 		 417 aa  208  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000117952  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1539  putative metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 418 aa  207  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2807  metal dependent phosphohydrolase  31.19 
 
 		 419 aa  206  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2489  metal dependent phosphohydrolase  31.01 
 
 		 416 aa  205  9e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1788  metal dependent phosphohydrolase  33.81 
 
 		 421 aa  205  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03619  hypothetical protein  30.66 
 
 		 416 aa  205  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2258  metal dependent phosphohydrolase  31.2 
 
 		 420 aa  203  6e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1942  HDIG domain-containing protein  31.54 
 
 		 420 aa  202  7e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1721  metal dependent phosphohydrolase  31.93 
 
 		 420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6453  normal  0.200178 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1652  metal dependent phosphohydrolase  31.3 
 
 		 420 aa  201  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.1275  hitchhiker  0.00033988 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1577  metal dependent phosphohydrolase  31.05 
 
 		 420 aa  199  7e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002441  HD-GYP domain-containing protein  29.85 
 
 		 417 aa  197  4.0000000000000005e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000172513  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2497  metal dependent phosphohydrolase  31.19 
 
 		 420 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.542039  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1847  metal dependent phosphohydrolase  31.19 
 
 		 420 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300439  hitchhiker  0.00112641 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2504  metal dependent phosphohydrolase  31.19 
 
 		 420 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.683485  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2617  metal dependent phosphohydrolase  31.19 
 
 		 421 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2333  hypothetical protein  27.34 
 
 		 426 aa  192  6e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.250947  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1979  metal dependent phosphohydrolase  28.29 
 
 		 431 aa  164  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334785  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0570  metal dependent phosphohydrolase  28.68 
 
 		 417 aa  157  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000128734 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0282  metal dependent phosphohydrolase  28.12 
 
 		 448 aa  142  7e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2511  hypothetical protein  28.41 
 
 		 446 aa  142  9e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  25.43 
 
 		 436 aa  137  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  28.45 
 
 		 395 aa  136  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2630  metal dependent phosphohydrolase  28.92 
 
 		 435 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  27.74 
 
 		 439 aa  131  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  25.75 
 
 		 411 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  25.72 
 
 		 406 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  26.51 
 
 		 404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  24.57 
 
 		 404 aa  120  6e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2785  metal dependent phosphohydrolase  26.68 
 
 		 448 aa  119  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.576348 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1930  metal dependent phosphohydrolase  32.59 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.421896  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  32.39 
 
 		 350 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  25.79 
 
 		 410 aa  117  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  26.14 
 
 		 409 aa  117  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  26.93 
 
 		 401 aa  117  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  25.57 
 
 		 413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  30.09 
 
 		 431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  28.07 
 
 		 366 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  26.35 
 
 		 403 aa  114  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0203  metal dependent phosphohydrolase  32.13 
 
 		 360 aa  114  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.640069  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  24.55 
 
 		 402 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  32.11 
 
 		 406 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  23.89 
 
 		 401 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  24.53 
 
 		 403 aa  113  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  26.8 
 
 		 427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  26.45 
 
 		 414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  30.99 
 
 		 395 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  30.77 
 
 		 410 aa  110  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  26.38 
 
 		 392 aa  111  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3871  metal dependent phosphohydrolase  30.61 
 
 		 396 aa  111  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1533  metal dependent phosphohydrolase  24.52 
 
 		 454 aa  111  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  28.76 
 
 		 448 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  28.19 
 
 		 448 aa  110  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  30.16 
 
 		 424 aa  110  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  23.82 
 
 		 402 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2302  HD domain-containing protein  27.51 
 
 		 421 aa  109  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.332838  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  24.92 
 
 		 419 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1261  metal dependent phosphohydrolase  34.44 
 
 		 356 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00227498  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  30.3 
 
 		 411 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  30.3 
 
 		 411 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  30.52 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  29.8 
 
 		 412 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1030  metal dependent phosphohydrolase  33.16 
 
 		 353 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.239219  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  30.61 
 
 		 392 aa  107  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  25.82 
 
 		 399 aa  107  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  28.57 
 
 		 390 aa  107  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1419  metal dependent phosphohydrolase  29.31 
 
 		 350 aa  107  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  29.74 
 
 		 388 aa  106  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  25.84 
 
 		 419 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2680  HD-GYP domain-containing protein  28.57 
 
 		 488 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.467072 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4304  metal dependent phosphohydrolase  31.35 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0096  metal dependent phosphohydrolase  31.35 
 
 		 396 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  26.88 
 
 		 400 aa  105  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1504  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.438459  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  30.27 
 
 		 394 aa  104  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  27.19 
 
 		 377 aa  104  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  25.5 
 
 		 400 aa  104  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  31.35 
 
 		 396 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  29.29 
 
 		 396 aa  104  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1502  metal dependent phosphohydrolase  33.15 
 
 		 377 aa  103  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.858643  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  27.33 
 
 		 364 aa  103  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  29.89 
 
 		 395 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>