More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2486 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2486  ABC transporter related  100 
 
 		 261 aa  535  1e-151  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2584  ABC transporter related  85.06 
 
 		 261 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1801  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  81.61 
 
 		 261 aa  441  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2488  ABC transporter related  82.38 
 
 		 261 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0320682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2654  ABC transporter related  82.38 
 
 		 261 aa  442  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.53593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1496  ABC transporter related  80.84 
 
 		 261 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2556  ABC transporter related  81.99 
 
 		 261 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.595528  normal  0.0638655 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1548  ABC transporter related  80.46 
 
 		 261 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.73885  hitchhiker  0.000980474 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1600  ABC transporter related  80.46 
 
 		 261 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00484848  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1634  ABC transporter related  80.46 
 
 		 261 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2743  ABC transporter related  80.46 
 
 		 261 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.39241  normal  0.48715 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1611  ABC transporter related  80.08 
 
 		 261 aa  434  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3106  ABC transporter related  79.69 
 
 		 262 aa  433  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.231583  hitchhiker  0.00000353059 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2502  ABC transporter-related protein  78.93 
 
 		 261 aa  432  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.143761  normal  0.275923 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1231  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  78.16 
 
 		 261 aa  429  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2675  ABC transporter related  78.93 
 
 		 261 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14935  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003820  peptide transport system ATP-binding protein SapF  55.65 
 
 		 263 aa  292  4e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0778601  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01866  hypothetical protein  54 
 
 		 260 aa  285  5.999999999999999e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3779  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  54.58 
 
 		 258 aa  284  8e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1289  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  52.78 
 
 		 262 aa  281  7.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2633  ABC transporter-related protein  53.04 
 
 		 270 aa  277  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.211449 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0475  peptide transport system ATP-binding protein SapF  53.68 
 
 		 255 aa  277  1e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1931  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  51.78 
 
 		 268 aa  273  3e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00733076 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1780  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  52.17 
 
 		 271 aa  272  5.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2544  peptide transport system ATP-binding protein  52.17 
 
 		 271 aa  272  5.000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1888  ABC transporter related  52.17 
 
 		 271 aa  272  5.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.26331  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01267  predicted antimicrobial peptide transporter subunit  51.38 
 
 		 268 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2356  ABC transporter related protein  51.38 
 
 		 268 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.61683  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2335  ABC transporter related  51.38 
 
 		 268 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0223767 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1526  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  51.38 
 
 		 268 aa  271  8.000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.629898  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1832  peptide transport system, ATP-binding protein SapF  51.38 
 
 		 268 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.865298  hitchhiker  0.0000646533 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1404  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  51.38 
 
 		 268 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.120035  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01278  hypothetical protein  51.38 
 
 		 268 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1497  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  51.38 
 
 		 268 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2196  ABC transporter ATP-binding protein  48.62 
 
 		 259 aa  270  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.936196  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1882  peptide ABC transporter ATP-binding protein SapF  50.59 
 
 		 268 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36018  hitchhiker  0.000716142 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1454  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  50.59 
 
 		 268 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1820  peptide ABC transporter ATP-binding protein SapF  50.59 
 
 		 268 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.90889e-16 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1636  peptide ABC transporter ATP-binding protein SapF  50.59 
 
 		 268 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.55489  hitchhiker  0.00000000158294 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1825  peptide transport system ATP-binding protein SapF  50.59 
 
 		 268 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.186073  hitchhiker  0.003112 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3010  ABC transporter related  51.61 
 
 		 261 aa  260  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2175  ABC transporter related  50.2 
 
 		 268 aa  260  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0158301 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0590  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.49 
 
 		 264 aa  247  1e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0142  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.03 
 
 		 329 aa  247  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3824  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.03 
 
 		 337 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3902  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.03 
 
 		 337 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3838  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.03 
 
 		 337 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3946  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.03 
 
 		 337 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0840867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4006  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.03 
 
 		 337 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4908  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.03 
 
 		 334 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3859  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.63 
 
 		 334 aa  245  6e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.712136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4032  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.63 
 
 		 334 aa  244  6.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03391  dipeptide transporter  45.63 
 
 		 334 aa  244  8e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0172  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.63 
 
 		 334 aa  244  8e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03342  hypothetical protein  45.63 
 
 		 334 aa  244  8e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3991  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.63 
 
 		 334 aa  244  8e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0175  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.63 
 
 		 334 aa  244  8e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3739  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.63 
 
 		 334 aa  244  8e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4094  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.22 
 
 		 335 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1748  ABC transporter related  48.62 
 
 		 271 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4071  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.43 
 
 		 358 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4060  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.43 
 
 		 358 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0092  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.43 
 
 		 358 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1714  ABC transporter related  48.22 
 
 		 271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308855  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2346  ABC transporter related  47.83 
 
 		 271 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1530  dipeptide transporter ATP-binding subunit  50.66 
 
 		 343 aa  242  3e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2617  ABC transporter related protein  47.83 
 
 		 271 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0151151  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0053  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.42 
 
 		 336 aa  242  5e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.146375  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0048  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.42 
 
 		 336 aa  241  7.999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3903  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.42 
 
 		 339 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.62068  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0188  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.82 
 
 		 337 aa  239  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0215713  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1586  ABC transporter related  45.1 
 
 		 282 aa  236  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.159648  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1582  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.49 
 
 		 282 aa  236  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.322929  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2360  dipeptide transporter ATP-binding subunit  44.44 
 
 		 344 aa  234  8e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0755  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.43 
 
 		 323 aa  232  5e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0800401 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0063  ABC transporter related  44.09 
 
 		 282 aa  230  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0307573  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  44.27 
 
 		 546 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0110  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.19 
 
 		 342 aa  230  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0394  dipeptide transporter ATP-binding subunit  43.65 
 
 		 317 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.193411 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3236  ABC peptide transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 		 282 aa  228  6e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6388  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.2 
 
 		 338 aa  228  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3973  ABC transporter related  42.86 
 
 		 282 aa  228  6e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4242  dipeptide transporter ATP-binding subunit  43.82 
 
 		 324 aa  228  8e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.410741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0917  dipeptide transporter ATP-binding subunit  44.22 
 
 		 322 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400518  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0809  dipeptide transporter ATP-binding subunit  44.22 
 
 		 326 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208502 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3750  dipeptide transporter ATP-binding subunit  43.85 
 
 		 339 aa  227  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.765741 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.57 
 
 		 423 aa  227  1e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.302511  normal  0.155474 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12480  Oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding component  44.58 
 
 		 319 aa  228  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0130592  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3060  dipeptide transporter ATP-binding subunit  44.8 
 
 		 338 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0486798 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0921  dipeptide transporter ATP-binding subunit  43.82 
 
 		 322 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal  0.93527 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1667  ABC transporter related  44.77 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4300  dipeptide transporter ATP-binding subunit  43.82 
 
 		 322 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0426  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 		 317 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.153009 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0186  dipeptide transporter ATP-binding subunit  43.2 
 
 		 339 aa  226  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2427  dipeptide transporter ATP-binding subunit  44.8 
 
 		 338 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2952  dipeptide transporter ATP-binding subunit  44 
 
 		 338 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3086  dipeptide transporter ATP-binding subunit  44 
 
 		 338 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3041  dipeptide transporter ATP-binding subunit  44.8 
 
 		 338 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0878  dipeptide transporter ATP-binding subunit  43.82 
 
 		 322 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3036  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.49 
 
 		 338 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.195523 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>