More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0475 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0475  peptide transport system ATP-binding protein SapF  100 
 
 
255 aa  526  1e-148  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01866  hypothetical protein  82.99 
 
 
260 aa  421  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003820  peptide transport system ATP-binding protein SapF  81.97 
 
 
263 aa  420  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0778601  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1289  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  81.25 
 
 
262 aa  413  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1780  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  60.16 
 
 
271 aa  312  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1888  ABC transporter related  60.16 
 
 
271 aa  312  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.26331  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2544  peptide transport system ATP-binding protein  60.16 
 
 
271 aa  311  4.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2633  ABC transporter-related protein  59.76 
 
 
270 aa  311  5.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.211449 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01267  predicted antimicrobial peptide transporter subunit  57.66 
 
 
268 aa  300  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2356  ABC transporter related protein  57.66 
 
 
268 aa  300  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.61683  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1931  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  57.66 
 
 
268 aa  300  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00733076 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1526  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  57.66 
 
 
268 aa  300  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.629898  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2335  ABC transporter related  57.66 
 
 
268 aa  300  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0223767 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1404  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  57.66 
 
 
268 aa  300  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.120035  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1497  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  57.66 
 
 
268 aa  300  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1832  peptide transport system, ATP-binding protein SapF  57.66 
 
 
268 aa  300  1e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.865298  hitchhiker  0.0000646533 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2175  ABC transporter related  58.05 
 
 
268 aa  300  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0158301 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01278  hypothetical protein  57.66 
 
 
268 aa  300  1e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1636  peptide ABC transporter ATP-binding protein SapF  57.26 
 
 
268 aa  298  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.55489  hitchhiker  0.00000000158294 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1825  peptide transport system ATP-binding protein SapF  57.26 
 
 
268 aa  298  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.186073  hitchhiker  0.003112 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1882  peptide ABC transporter ATP-binding protein SapF  57.26 
 
 
268 aa  298  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36018  hitchhiker  0.000716142 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1820  peptide ABC transporter ATP-binding protein SapF  57.26 
 
 
268 aa  298  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  6.90889e-16 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1454  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  57.26 
 
 
268 aa  298  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2346  ABC transporter related  57.87 
 
 
271 aa  291  6e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2617  ABC transporter related protein  57.87 
 
 
271 aa  290  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0151151  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1634  ABC transporter related  54.55 
 
 
261 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1600  ABC transporter related  54.55 
 
 
261 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00484848  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2743  ABC transporter related  54.55 
 
 
261 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.39241  normal  0.48715 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1611  ABC transporter related  54.55 
 
 
261 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1714  ABC transporter related  55.93 
 
 
271 aa  281  7.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308855  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3106  ABC transporter related  54.11 
 
 
262 aa  280  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.231583  hitchhiker  0.00000353059 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1748  ABC transporter related  56.17 
 
 
271 aa  279  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1231  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  53.91 
 
 
261 aa  280  2e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2502  ABC transporter-related protein  52.81 
 
 
261 aa  279  3e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.143761  normal  0.275923 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1496  ABC transporter related  53.68 
 
 
261 aa  279  3e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2486  ABC transporter related  53.68 
 
 
261 aa  277  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2488  ABC transporter related  53.68 
 
 
261 aa  277  1e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0320682 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2556  ABC transporter related  53.68 
 
 
261 aa  277  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.595528  normal  0.0638655 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2654  ABC transporter related  53.68 
 
 
261 aa  277  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.53593  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1801  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  53.25 
 
 
261 aa  276  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1548  ABC transporter related  53.25 
 
 
261 aa  276  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.73885  hitchhiker  0.000980474 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2584  ABC transporter related  53.25 
 
 
261 aa  271  6e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0590  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  50.44 
 
 
264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2675  ABC transporter related  53.22 
 
 
261 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14935  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3779  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  48.28 
 
 
258 aa  247  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3010  ABC transporter related  50 
 
 
261 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2196  ABC transporter ATP-binding protein  45.18 
 
 
259 aa  229  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.936196  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4908  dipeptide transporter ATP-binding subunit  43.8 
 
 
334 aa  217  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03391  dipeptide transporter  43.39 
 
 
334 aa  216  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0172  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.39 
 
 
334 aa  216  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4032  dipeptide transporter ATP-binding subunit  43.39 
 
 
334 aa  216  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03342  hypothetical protein  43.39 
 
 
334 aa  216  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3739  dipeptide transporter ATP-binding subunit  43.39 
 
 
334 aa  216  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3991  dipeptide transporter ATP-binding subunit  43.39 
 
 
334 aa  217  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0175  dipeptide transporter ATP-binding subunit  43.39 
 
 
334 aa  216  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3859  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.98 
 
 
334 aa  216  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.712136  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3946  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.87 
 
 
337 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0840867  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3824  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.87 
 
 
337 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3838  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.87 
 
 
337 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3902  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.87 
 
 
337 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4006  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.87 
 
 
337 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02839  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.18 
 
 
267 aa  211  5.999999999999999e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0394  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.84 
 
 
317 aa  210  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.193411 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3903  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.46 
 
 
339 aa  209  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.62068  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2815  dipeptide transporter ATP-binding subunit  43.23 
 
 
339 aa  209  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.717135  normal  0.0541918 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0426  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.84 
 
 
317 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.153009 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0110  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.39 
 
 
342 aa  209  5e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0188  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.91 
 
 
337 aa  209  5e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0215713  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0809  dipeptide transporter ATP-binding subunit  43.86 
 
 
326 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.208502 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5120  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.98 
 
 
323 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4060  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.65 
 
 
358 aa  206  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4071  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.32 
 
 
358 aa  206  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58490  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.98 
 
 
323 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0142  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.24 
 
 
329 aa  206  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0092  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.65 
 
 
358 aa  206  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4094  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.24 
 
 
335 aa  205  6e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3750  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.37 
 
 
339 aa  205  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.765741 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0053  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.91 
 
 
336 aa  205  7e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.146375  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4242  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.98 
 
 
324 aa  204  8e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.410741  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1594  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.34 
 
 
441 aa  204  1e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0048  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.91 
 
 
336 aa  204  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2360  dipeptide transporter ATP-binding subunit  38.96 
 
 
344 aa  203  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4300  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.54 
 
 
322 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0921  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.54 
 
 
322 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal  0.93527 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1586  ABC transporter related  42.13 
 
 
282 aa  203  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.159648  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0878  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.54 
 
 
322 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0917  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.54 
 
 
322 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400518  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1270  ABC transporter related  39.04 
 
 
308 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0398  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.77 
 
 
348 aa  201  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0186  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.96 
 
 
339 aa  201  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12480  Oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding component  40.08 
 
 
319 aa  201  7e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0130592  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0755  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.76 
 
 
323 aa  201  8e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0800401 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0486  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.85 
 
 
329 aa  201  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0224  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.96 
 
 
338 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  42.5 
 
 
619 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0442  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.56 
 
 
338 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.530658  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6388  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.76 
 
 
338 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0247  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.56 
 
 
338 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.169504  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0260  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.56 
 
 
338 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0837  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.05 
 
 
323 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>