More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003820 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003820  peptide transport system ATP-binding protein SapF  100 
 
 		 263 aa  542  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0778601  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01866  hypothetical protein  96.15 
 
 		 260 aa  515  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1289  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  82.63 
 
 		 262 aa  456  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0475  peptide transport system ATP-binding protein SapF  81.97 
 
 		 255 aa  420  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1888  ABC transporter related  62.99 
 
 		 271 aa  337  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.26331  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1780  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  62.99 
 
 		 271 aa  337  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2544  peptide transport system ATP-binding protein  62.99 
 
 		 271 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2633  ABC transporter-related protein  62.65 
 
 		 270 aa  336  2.9999999999999997e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.211449 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1931  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  59.53 
 
 		 268 aa  322  4e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00733076 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01267  predicted antimicrobial peptide transporter subunit  59.14 
 
 		 268 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2356  ABC transporter related protein  59.14 
 
 		 268 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.61683  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1404  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  59.14 
 
 		 268 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.120035  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01278  hypothetical protein  59.14 
 
 		 268 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2335  ABC transporter related  59.14 
 
 		 268 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0223767 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1497  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  59.14 
 
 		 268 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1832  peptide transport system, ATP-binding protein SapF  59.14 
 
 		 268 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.865298  hitchhiker  0.0000646533 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1526  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  59.14 
 
 		 268 aa  321  9.999999999999999e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.629898  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2175  ABC transporter related  60.24 
 
 		 268 aa  320  1.9999999999999998e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0158301 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1454  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  58.82 
 
 		 268 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1820  peptide ABC transporter ATP-binding protein SapF  58.82 
 
 		 268 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.90889e-16 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1825  peptide transport system ATP-binding protein SapF  58.82 
 
 		 268 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.186073  hitchhiker  0.003112 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1882  peptide ABC transporter ATP-binding protein SapF  58.82 
 
 		 268 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36018  hitchhiker  0.000716142 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1636  peptide ABC transporter ATP-binding protein SapF  58.82 
 
 		 268 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.55489  hitchhiker  0.00000000158294 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2617  ABC transporter related protein  57.42 
 
 		 271 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0151151  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2346  ABC transporter related  57.42 
 
 		 271 aa  306  3e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1714  ABC transporter related  57.03 
 
 		 271 aa  297  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308855  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1748  ABC transporter related  56.64 
 
 		 271 aa  296  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1231  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  55.47 
 
 		 261 aa  294  1e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2502  ABC transporter-related protein  53.6 
 
 		 261 aa  293  3e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.143761  normal  0.275923 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3106  ABC transporter related  55.2 
 
 		 262 aa  292  3e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.231583  hitchhiker  0.00000353059 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2486  ABC transporter related  55.65 
 
 		 261 aa  292  4e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1634  ABC transporter related  54 
 
 		 261 aa  291  6e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1600  ABC transporter related  54 
 
 		 261 aa  291  6e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00484848  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2743  ABC transporter related  54 
 
 		 261 aa  291  6e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.39241  normal  0.48715 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1611  ABC transporter related  54.44 
 
 		 261 aa  291  7e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1548  ABC transporter related  53.6 
 
 		 261 aa  287  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.73885  hitchhiker  0.000980474 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1496  ABC transporter related  53.2 
 
 		 261 aa  285  4e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2556  ABC transporter related  52.8 
 
 		 261 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.595528  normal  0.0638655 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2654  ABC transporter related  52.8 
 
 		 261 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.53593  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1801  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  52.8 
 
 		 261 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2488  ABC transporter related  52.8 
 
 		 261 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0320682 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2584  ABC transporter related  54.03 
 
 		 261 aa  280  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2675  ABC transporter related  53.6 
 
 		 261 aa  266  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14935  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0590  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  48.21 
 
 		 264 aa  263  3e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3779  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.09 
 
 		 258 aa  259  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3010  ABC transporter related  48.22 
 
 		 261 aa  251  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2196  ABC transporter ATP-binding protein  44.27 
 
 		 259 aa  245  6.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.936196  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0224  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.67 
 
 		 338 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  43.56 
 
 		 629 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  43.23 
 
 		 623 aa  216  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  43.56 
 
 		 612 aa  215  5e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  43.56 
 
 		 623 aa  215  5e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  43.56 
 
 		 623 aa  215  5e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  43.56 
 
 		 623 aa  215  5e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  43.56 
 
 		 612 aa  215  5e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  43.56 
 
 		 623 aa  215  5e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  43.56 
 
 		 623 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0186  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.48 
 
 		 339 aa  214  9e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0442  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.87 
 
 		 338 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.530658  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0809  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.62 
 
 		 326 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208502 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0247  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.87 
 
 		 338 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.169504  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0260  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.87 
 
 		 338 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02839  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.96 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0426  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.48 
 
 		 317 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.153009 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0394  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.48 
 
 		 317 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.193411 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0999  glutathione transporter ATP-binding protein  43.18 
 
 		 623 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.666718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0949  glutathione transporter ATP-binding protein  43.18 
 
 		 623 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0889  glutathione transporter ATP-binding protein  43.18 
 
 		 623 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448185  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0978  glutathione transporter ATP-binding protein  43.18 
 
 		 623 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3750  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.08 
 
 		 339 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.765741 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  42.19 
 
 		 370 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6388  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.92 
 
 		 338 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4094  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.11 
 
 		 335 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2910  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.68 
 
 		 345 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3036  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.08 
 
 		 338 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.195523 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3305  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.48 
 
 		 338 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2973  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.48 
 
 		 338 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.445029  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2117  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.48 
 
 		 338 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3374  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.48 
 
 		 338 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0916  glutathione transporter ATP-binding protein  42.8 
 
 		 623 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2952  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.53 
 
 		 338 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2360  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.53 
 
 		 344 aa  210  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2815  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.94 
 
 		 339 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.717135  normal  0.0541918 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3086  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.53 
 
 		 338 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3859  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.92 
 
 		 334 aa  209  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.712136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3903  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.71 
 
 		 339 aa  209  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.62068  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4242  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.84 
 
 		 324 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.410741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3060  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.13 
 
 		 338 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0486798 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2427  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.13 
 
 		 338 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3041  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.13 
 
 		 338 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4908  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.92 
 
 		 334 aa  208  8e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0053  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.92 
 
 		 336 aa  207  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.146375  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3991  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.53 
 
 		 334 aa  207  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03391  dipeptide transporter  39.53 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0172  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.53 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3739  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.53 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0110  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.91 
 
 		 342 aa  206  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4032  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.53 
 
 		 334 aa  206  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0110  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.43 
 
 		 328 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.771094 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03342  hypothetical protein  39.53 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>