More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1714 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1714  ABC transporter related  100 
 
 
271 aa  552  1e-156  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308855  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1748  ABC transporter related  91.04 
 
 
271 aa  504  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2617  ABC transporter related protein  87.73 
 
 
271 aa  488  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0151151  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2346  ABC transporter related  87.73 
 
 
271 aa  488  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1636  peptide ABC transporter ATP-binding protein SapF  82.02 
 
 
268 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.55489  hitchhiker  0.00000000158294 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1820  peptide ABC transporter ATP-binding protein SapF  82.02 
 
 
268 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  6.90889e-16 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1825  peptide transport system ATP-binding protein SapF  82.02 
 
 
268 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.186073  hitchhiker  0.003112 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1882  peptide ABC transporter ATP-binding protein SapF  82.02 
 
 
268 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36018  hitchhiker  0.000716142 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1454  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  82.02 
 
 
268 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01267  predicted antimicrobial peptide transporter subunit  81.65 
 
 
268 aa  456  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01278  hypothetical protein  81.65 
 
 
268 aa  456  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2356  ABC transporter related protein  81.65 
 
 
268 aa  456  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.61683  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2335  ABC transporter related  81.65 
 
 
268 aa  456  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0223767 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1931  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  81.65 
 
 
268 aa  457  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00733076 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2633  ABC transporter-related protein  82.09 
 
 
270 aa  454  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.211449 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1526  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  81.65 
 
 
268 aa  456  1e-127  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.629898  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1404  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  81.65 
 
 
268 aa  456  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.120035  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1832  peptide transport system, ATP-binding protein SapF  81.65 
 
 
268 aa  456  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.865298  hitchhiker  0.0000646533 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1497  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  81.65 
 
 
268 aa  456  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1780  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  81.65 
 
 
271 aa  447  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1888  ABC transporter related  81.65 
 
 
271 aa  447  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.26331  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2544  peptide transport system ATP-binding protein  81.65 
 
 
271 aa  446  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2175  ABC transporter related  79.4 
 
 
268 aa  440  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0158301 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1289  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  56.69 
 
 
262 aa  298  6e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0590  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  53.26 
 
 
264 aa  297  1e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003820  peptide transport system ATP-binding protein SapF  57.03 
 
 
263 aa  297  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0778601  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01866  hypothetical protein  57.09 
 
 
260 aa  297  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0475  peptide transport system ATP-binding protein SapF  55.93 
 
 
255 aa  281  7.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1634  ABC transporter related  50.2 
 
 
261 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1600  ABC transporter related  50.2 
 
 
261 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00484848  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2743  ABC transporter related  50.2 
 
 
261 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.39241  normal  0.48715 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1611  ABC transporter related  50.2 
 
 
261 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1231  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  49.61 
 
 
261 aa  250  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1496  ABC transporter related  48.62 
 
 
261 aa  248  6e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2556  ABC transporter related  49.01 
 
 
261 aa  248  8e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.595528  normal  0.0638655 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2488  ABC transporter related  49.01 
 
 
261 aa  248  9e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0320682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2654  ABC transporter related  49.01 
 
 
261 aa  248  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.53593  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3779  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.24 
 
 
258 aa  246  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1801  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  48.22 
 
 
261 aa  247  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3106  ABC transporter related  47.43 
 
 
262 aa  246  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.231583  hitchhiker  0.00000353059 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1548  ABC transporter related  47.43 
 
 
261 aa  246  3e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.73885  hitchhiker  0.000980474 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2486  ABC transporter related  48.22 
 
 
261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2584  ABC transporter related  47.43 
 
 
261 aa  242  5e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2502  ABC transporter-related protein  46.61 
 
 
261 aa  242  5e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.143761  normal  0.275923 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2675  ABC transporter related  46.22 
 
 
261 aa  228  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14935  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0426  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.73 
 
 
317 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.153009 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3010  ABC transporter related  44.66 
 
 
261 aa  225  6e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2196  ABC transporter ATP-binding protein  42.8 
 
 
259 aa  225  6e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.936196  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0394  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.34 
 
 
317 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.193411 
 
 
-
 
NC_004310  BR1582  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.63 
 
 
282 aa  211  9e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.322929  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02839  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.41 
 
 
267 aa  211  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1586  ABC transporter related  41.63 
 
 
282 aa  210  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.159648  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2815  dipeptide transporter ATP-binding subunit  38.43 
 
 
339 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.717135  normal  0.0541918 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0063  ABC transporter related  39.3 
 
 
282 aa  209  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0307573  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3305  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.76 
 
 
338 aa  208  9e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2973  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.76 
 
 
338 aa  208  9e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.445029  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2117  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.76 
 
 
338 aa  208  9e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3374  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.76 
 
 
338 aa  208  9e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3036  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.16 
 
 
338 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.195523 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4060  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.13 
 
 
358 aa  207  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0092  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.13 
 
 
358 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0398  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.85 
 
 
348 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4071  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.13 
 
 
358 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0486  dipeptide transporter ATP-binding subunit  38.55 
 
 
329 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3903  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.53 
 
 
339 aa  206  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.62068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0442  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.37 
 
 
338 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.530658  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6388  dipeptide transporter ATP-binding subunit  38.98 
 
 
338 aa  206  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0224  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.76 
 
 
338 aa  206  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0247  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.37 
 
 
338 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.169504  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0260  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.37 
 
 
338 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2952  dipeptide transporter ATP-binding subunit  38.98 
 
 
338 aa  205  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3086  dipeptide transporter ATP-binding subunit  38.98 
 
 
338 aa  205  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4094  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.25 
 
 
335 aa  205  7e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0053  dipeptide transporter ATP-binding subunit  38.74 
 
 
336 aa  205  7e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.146375  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0142  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.84 
 
 
329 aa  204  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3060  dipeptide transporter ATP-binding subunit  38.58 
 
 
338 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0486798 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3838  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.45 
 
 
337 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5120  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.84 
 
 
323 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3946  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.45 
 
 
337 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0840867  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0186  dipeptide transporter ATP-binding subunit  38.49 
 
 
339 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3902  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.45 
 
 
337 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2427  dipeptide transporter ATP-binding subunit  38.58 
 
 
338 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3824  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.45 
 
 
337 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58490  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.84 
 
 
323 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0048  dipeptide transporter ATP-binding subunit  38.74 
 
 
336 aa  203  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3041  dipeptide transporter ATP-binding subunit  38.58 
 
 
338 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4006  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.45 
 
 
337 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1950  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.08 
 
 
334 aa  203  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.189819  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0333  ABC transporter related  39.92 
 
 
275 aa  202  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.069835 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12480  Oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding component  40.8 
 
 
319 aa  202  5e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0130592  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0809  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.13 
 
 
326 aa  202  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.208502 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3236  ABC peptide transporter, ATPase subunit  39.37 
 
 
282 aa  202  7e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4908  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.45 
 
 
334 aa  201  7e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3973  ABC transporter related  39.37 
 
 
282 aa  202  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3503  ABC transporter related  40.96 
 
 
288 aa  202  7e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.365149  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1270  ABC transporter related  38.43 
 
 
308 aa  202  7e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3750  dipeptide transporter ATP-binding subunit  38.1 
 
 
339 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.765741 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4300  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.06 
 
 
322 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0188  dipeptide transporter ATP-binding subunit  37.94 
 
 
337 aa  201  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0215713  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2910  dipeptide transporter ATP-binding subunit  38.49 
 
 
345 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>