More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02839 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02839  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 267 aa  546  1e-154  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3010  ABC transporter related  58.46 
 
 		 261 aa  311  9e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3779  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.64 
 
 		 258 aa  238  6.999999999999999e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2743  ABC transporter related  47.22 
 
 		 261 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.39241  normal  0.48715 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1600  ABC transporter related  47.22 
 
 		 261 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00484848  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1634  ABC transporter related  47.22 
 
 		 261 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1611  ABC transporter related  47.22 
 
 		 261 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1496  ABC transporter related  47.22 
 
 		 261 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1801  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.83 
 
 		 261 aa  231  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2488  ABC transporter related  47.22 
 
 		 261 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0320682 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2556  ABC transporter related  47.22 
 
 		 261 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.595528  normal  0.0638655 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2654  ABC transporter related  47.22 
 
 		 261 aa  231  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.53593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2584  ABC transporter related  45 
 
 		 261 aa  229  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1548  ABC transporter related  44.44 
 
 		 261 aa  227  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.73885  hitchhiker  0.000980474 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2486  ABC transporter related  48.12 
 
 		 261 aa  225  6e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3106  ABC transporter related  45.24 
 
 		 262 aa  224  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.231583  hitchhiker  0.00000353059 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1231  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.93 
 
 		 261 aa  223  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2502  ABC transporter-related protein  47.26 
 
 		 261 aa  221  7e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.143761  normal  0.275923 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1931  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  42.8 
 
 		 268 aa  217  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00733076 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01267  predicted antimicrobial peptide transporter subunit  42.8 
 
 		 268 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2356  ABC transporter related protein  42.8 
 
 		 268 aa  217  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.61683  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1497  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  42.8 
 
 		 268 aa  217  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1526  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  42.8 
 
 		 268 aa  217  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.629898  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1404  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  42.8 
 
 		 268 aa  217  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.120035  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2335  ABC transporter related  42.8 
 
 		 268 aa  217  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0223767 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01278  hypothetical protein  42.8 
 
 		 268 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1832  peptide transport system, ATP-binding protein SapF  42.8 
 
 		 268 aa  217  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.865298  hitchhiker  0.0000646533 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1748  ABC transporter related  42.35 
 
 		 271 aa  215  5e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1888  ABC transporter related  42.35 
 
 		 271 aa  214  8e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.26331  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1780  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  42.35 
 
 		 271 aa  214  8e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01866  hypothetical protein  41.67 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003820  peptide transport system ATP-binding protein SapF  41.96 
 
 		 263 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0778601  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2544  peptide transport system ATP-binding protein  42.35 
 
 		 271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2633  ABC transporter-related protein  41.96 
 
 		 270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.211449 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0475  peptide transport system ATP-binding protein SapF  45.18 
 
 		 255 aa  211  7e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1882  peptide ABC transporter ATP-binding protein SapF  41.63 
 
 		 268 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36018  hitchhiker  0.000716142 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1636  peptide ABC transporter ATP-binding protein SapF  41.63 
 
 		 268 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.55489  hitchhiker  0.00000000158294 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1820  peptide ABC transporter ATP-binding protein SapF  41.63 
 
 		 268 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.90889e-16 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1714  ABC transporter related  41.41 
 
 		 271 aa  211  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308855  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1825  peptide transport system ATP-binding protein SapF  41.63 
 
 		 268 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.186073  hitchhiker  0.003112 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1454  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  41.63 
 
 		 268 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2675  ABC transporter related  45.24 
 
 		 261 aa  209  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14935  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2346  ABC transporter related  40.62 
 
 		 271 aa  209  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2175  ABC transporter related  42.19 
 
 		 268 aa  209  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0158301 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2617  ABC transporter related protein  40.62 
 
 		 271 aa  209  5e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0151151  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4094  dipeptide transporter ATP-binding subunit  44.4 
 
 		 335 aa  205  8e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3824  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.91 
 
 		 337 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4006  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.91 
 
 		 337 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0142  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.75 
 
 		 329 aa  203  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3838  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.91 
 
 		 337 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3946  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.91 
 
 		 337 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0840867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3902  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.91 
 
 		 337 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3991  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.42 
 
 		 334 aa  203  3e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4071  dipeptide transporter ATP-binding subunit  43.13 
 
 		 358 aa  202  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3859  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.42 
 
 		 334 aa  202  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.712136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4060  dipeptide transporter ATP-binding subunit  43.13 
 
 		 358 aa  202  4e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0092  dipeptide transporter ATP-binding subunit  43.13 
 
 		 358 aa  202  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1289  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.49 
 
 		 262 aa  202  4e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4908  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.05 
 
 		 334 aa  202  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03391  dipeptide transporter  42.42 
 
 		 334 aa  202  5e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0172  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.42 
 
 		 334 aa  202  5e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03342  hypothetical protein  42.42 
 
 		 334 aa  202  5e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0175  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.42 
 
 		 334 aa  202  5e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4032  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.42 
 
 		 334 aa  202  5e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3739  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.42 
 
 		 334 aa  202  5e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0053  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 		 336 aa  202  6e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.146375  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0048  dipeptide transporter ATP-binding subunit  43.25 
 
 		 336 aa  201  8e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2196  ABC transporter ATP-binding protein  44.16 
 
 		 259 aa  201  8e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.936196  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1694  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.08 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0837  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.38 
 
 		 323 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1667  ABC transporter related  46.46 
 
 		 283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3903  dipeptide transporter ATP-binding subunit  43.12 
 
 		 339 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.62068  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4242  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.37 
 
 		 324 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.410741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0486  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.15 
 
 		 329 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1586  ABC transporter related  41.02 
 
 		 282 aa  198  9e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.159648  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4300  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.98 
 
 		 322 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58490  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.51 
 
 		 323 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5120  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.51 
 
 		 323 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12480  Oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding component  43.35 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0130592  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1582  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.62 
 
 		 282 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.322929  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0921  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.98 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal  0.93527 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0917  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.6 
 
 		 322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400518  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0188  dipeptide transporter ATP-binding subunit  43.14 
 
 		 337 aa  196  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0215713  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0110  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.27 
 
 		 342 aa  196  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0878  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.6 
 
 		 322 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2051  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.15 
 
 		 325 aa  192  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.953571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0809  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.84 
 
 		 326 aa  191  9e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208502 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0333  ABC transporter related  44.21 
 
 		 275 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.069835 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0394  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.39 
 
 		 317 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.193411 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2815  dipeptide transporter ATP-binding subunit  38.2 
 
 		 339 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.717135  normal  0.0541918 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0727  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.74 
 
 		 308 aa  189  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0426  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40 
 
 		 317 aa  188  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.153009 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0626  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  42.74 
 
 		 308 aa  188  9e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0569  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.74 
 
 		 308 aa  188  9e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0659  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  42.74 
 
 		 308 aa  188  9e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.575275  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0788  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.74 
 
 		 308 aa  188  9e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0634106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0716  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.74 
 
 		 308 aa  188  9e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000233806 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3236  ABC peptide transporter, ATPase subunit  43.36 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3973  ABC transporter related  43.36 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0063  ABC transporter related  42.55 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0307573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>