More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3010 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3010  ABC transporter related  100 
 
 		 261 aa  533  1e-151  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02839  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  58.46 
 
 		 267 aa  311  9e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2502  ABC transporter-related protein  52.02 
 
 		 261 aa  263  3e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.143761  normal  0.275923 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2743  ABC transporter related  50.79 
 
 		 261 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.39241  normal  0.48715 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1611  ABC transporter related  50.79 
 
 		 261 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1634  ABC transporter related  50.79 
 
 		 261 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1600  ABC transporter related  50.79 
 
 		 261 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00484848  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2486  ABC transporter related  51.61 
 
 		 261 aa  260  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1801  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  51.63 
 
 		 261 aa  256  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1231  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  50.61 
 
 		 261 aa  256  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3779  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  52 
 
 		 258 aa  256  3e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1548  ABC transporter related  50.59 
 
 		 261 aa  256  3e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.73885  hitchhiker  0.000980474 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2556  ABC transporter related  51.22 
 
 		 261 aa  256  3e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.595528  normal  0.0638655 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2584  ABC transporter related  50.4 
 
 		 261 aa  256  3e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2654  ABC transporter related  51.22 
 
 		 261 aa  256  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.53593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2488  ABC transporter related  51.22 
 
 		 261 aa  255  6e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0320682 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1496  ABC transporter related  50.39 
 
 		 261 aa  255  6e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003820  peptide transport system ATP-binding protein SapF  48.22 
 
 		 263 aa  251  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0778601  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3106  ABC transporter related  49.8 
 
 		 262 aa  250  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.231583  hitchhiker  0.00000353059 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01866  hypothetical protein  48.22 
 
 		 260 aa  248  7e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0475  peptide transport system ATP-binding protein SapF  50 
 
 		 255 aa  244  8e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2675  ABC transporter related  50.81 
 
 		 261 aa  241  6e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14935  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1289  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.66 
 
 		 262 aa  241  7.999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2544  peptide transport system ATP-binding protein  47.84 
 
 		 271 aa  240  1e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1888  ABC transporter related  47.84 
 
 		 271 aa  239  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.26331  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1780  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  47.84 
 
 		 271 aa  239  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2633  ABC transporter-related protein  44.66 
 
 		 270 aa  235  7e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.211449 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1931  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  44.27 
 
 		 268 aa  230  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00733076 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01267  predicted antimicrobial peptide transporter subunit  43.87 
 
 		 268 aa  229  4e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2356  ABC transporter related protein  43.87 
 
 		 268 aa  229  4e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.61683  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1526  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  43.87 
 
 		 268 aa  229  4e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.629898  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1404  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  43.87 
 
 		 268 aa  229  4e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.120035  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01278  hypothetical protein  43.87 
 
 		 268 aa  229  4e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1497  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  43.87 
 
 		 268 aa  229  4e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2335  ABC transporter related  43.87 
 
 		 268 aa  229  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0223767 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1832  peptide transport system, ATP-binding protein SapF  43.87 
 
 		 268 aa  229  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.865298  hitchhiker  0.0000646533 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1748  ABC transporter related  45.45 
 
 		 271 aa  228  6e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2346  ABC transporter related  48.2 
 
 		 271 aa  228  8e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2617  ABC transporter related protein  48.2 
 
 		 271 aa  226  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0151151  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1636  peptide ABC transporter ATP-binding protein SapF  43.08 
 
 		 268 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.55489  hitchhiker  0.00000000158294 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1820  peptide ABC transporter ATP-binding protein SapF  43.08 
 
 		 268 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.90889e-16 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1454  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  43.08 
 
 		 268 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1825  peptide transport system ATP-binding protein SapF  43.08 
 
 		 268 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.186073  hitchhiker  0.003112 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1882  peptide ABC transporter ATP-binding protein SapF  43.08 
 
 		 268 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36018  hitchhiker  0.000716142 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1714  ABC transporter related  44.66 
 
 		 271 aa  225  6e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308855  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2175  ABC transporter related  45.1 
 
 		 268 aa  224  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0158301 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2196  ABC transporter ATP-binding protein  42.91 
 
 		 259 aa  219  5e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.936196  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0394  dipeptide transporter ATP-binding subunit  48.42 
 
 		 317 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.193411 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12480  Oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding component  48.46 
 
 		 319 aa  216  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0130592  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1530  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.81 
 
 		 343 aa  216  4e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0426  dipeptide transporter ATP-binding subunit  48.42 
 
 		 317 aa  215  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.153009 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4071  dipeptide transporter ATP-binding subunit  47.37 
 
 		 358 aa  214  8e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0092  dipeptide transporter ATP-binding subunit  47.37 
 
 		 358 aa  214  9e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4060  dipeptide transporter ATP-binding subunit  47.37 
 
 		 358 aa  214  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0142  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.88 
 
 		 329 aa  213  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2051  dipeptide transporter ATP-binding subunit  48.28 
 
 		 325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.953571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4908  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.88 
 
 		 334 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4032  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.88 
 
 		 334 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03391  dipeptide transporter  46.88 
 
 		 334 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0172  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.88 
 
 		 334 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0175  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.88 
 
 		 334 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3739  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.88 
 
 		 334 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3991  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.88 
 
 		 334 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03342  hypothetical protein  46.88 
 
 		 334 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4094  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.88 
 
 		 335 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0053  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.43 
 
 		 336 aa  211  7e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.146375  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3859  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.88 
 
 		 334 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.712136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0755  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.53 
 
 		 323 aa  211  9e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0800401 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2360  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.32 
 
 		 344 aa  210  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3902  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.43 
 
 		 337 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4006  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.43 
 
 		 337 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3838  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.43 
 
 		 337 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0048  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.43 
 
 		 336 aa  210  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3824  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.43 
 
 		 337 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3946  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.43 
 
 		 337 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0840867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0188  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.98 
 
 		 337 aa  210  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0215713  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0590  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.69 
 
 		 264 aa  208  6e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2427  dipeptide transporter ATP-binding subunit  43.75 
 
 		 338 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3086  dipeptide transporter ATP-binding subunit  43.75 
 
 		 338 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3041  dipeptide transporter ATP-binding subunit  43.75 
 
 		 338 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3060  dipeptide transporter ATP-binding subunit  43.75 
 
 		 338 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0486798 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2952  dipeptide transporter ATP-binding subunit  43.75 
 
 		 338 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0486  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.69 
 
 		 329 aa  206  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4300  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.18 
 
 		 322 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0809  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.98 
 
 		 326 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208502 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6388  dipeptide transporter ATP-binding subunit  43.75 
 
 		 338 aa  206  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3903  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.98 
 
 		 339 aa  206  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.62068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58490  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.91 
 
 		 323 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0837  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.18 
 
 		 323 aa  206  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3305  dipeptide transporter ATP-binding subunit  43.51 
 
 		 338 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0921  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.18 
 
 		 322 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal  0.93527 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2973  dipeptide transporter ATP-binding subunit  43.51 
 
 		 338 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.445029  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5120  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.91 
 
 		 323 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2117  dipeptide transporter ATP-binding subunit  43.51 
 
 		 338 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3374  dipeptide transporter ATP-binding subunit  43.51 
 
 		 338 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0917  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.61 
 
 		 322 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400518  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4242  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.43 
 
 		 324 aa  205  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.410741  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0878  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.61 
 
 		 322 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0442  dipeptide transporter ATP-binding subunit  43.1 
 
 		 338 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.530658  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1694  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.26 
 
 		 334 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>