More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2556 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2556  ABC transporter related  100 
 
 
261 aa  535  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.595528  normal  0.0638655 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2488  ABC transporter related  99.23 
 
 
261 aa  531  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0320682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2654  ABC transporter related  99.62 
 
 
261 aa  533  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.53593  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1801  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  97.7 
 
 
261 aa  526  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2743  ABC transporter related  95.02 
 
 
261 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.39241  normal  0.48715 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1496  ABC transporter related  95.02 
 
 
261 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1634  ABC transporter related  95.02 
 
 
261 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1600  ABC transporter related  95.02 
 
 
261 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00484848  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1611  ABC transporter related  94.64 
 
 
261 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3106  ABC transporter related  83.91 
 
 
262 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.231583  hitchhiker  0.00000353059 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1548  ABC transporter related  84.67 
 
 
261 aa  450  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.73885  hitchhiker  0.000980474 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2502  ABC transporter-related protein  81.99 
 
 
261 aa  448  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.143761  normal  0.275923 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2584  ABC transporter related  82.76 
 
 
261 aa  440  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2486  ABC transporter related  81.99 
 
 
261 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1231  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  80.84 
 
 
261 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2675  ABC transporter related  83.52 
 
 
261 aa  434  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14935  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003820  peptide transport system ATP-binding protein SapF  52.8 
 
 
263 aa  284  1.0000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0778601  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1289  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  52.4 
 
 
262 aa  279  3e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3779  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  54.55 
 
 
258 aa  279  3e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2633  ABC transporter-related protein  55.02 
 
 
270 aa  279  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.211449 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01866  hypothetical protein  52 
 
 
260 aa  277  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0475  peptide transport system ATP-binding protein SapF  53.68 
 
 
255 aa  277  1e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1780  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  53.36 
 
 
271 aa  274  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2544  peptide transport system ATP-binding protein  53.36 
 
 
271 aa  273  1.0000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1888  ABC transporter related  53.36 
 
 
271 aa  274  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.26331  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01267  predicted antimicrobial peptide transporter subunit  51.38 
 
 
268 aa  267  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2356  ABC transporter related protein  51.38 
 
 
268 aa  267  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.61683  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01278  hypothetical protein  51.38 
 
 
268 aa  267  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1404  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  51.38 
 
 
268 aa  267  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.120035  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2335  ABC transporter related  51.38 
 
 
268 aa  267  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0223767 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1497  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  51.38 
 
 
268 aa  267  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1832  peptide transport system, ATP-binding protein SapF  51.38 
 
 
268 aa  267  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.865298  hitchhiker  0.0000646533 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1526  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  51.38 
 
 
268 aa  267  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.629898  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1931  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  51.38 
 
 
268 aa  266  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00733076 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1825  peptide transport system ATP-binding protein SapF  50.99 
 
 
268 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.186073  hitchhiker  0.003112 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1882  peptide ABC transporter ATP-binding protein SapF  50.99 
 
 
268 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36018  hitchhiker  0.000716142 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1454  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  50.99 
 
 
268 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1636  peptide ABC transporter ATP-binding protein SapF  50.99 
 
 
268 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.55489  hitchhiker  0.00000000158294 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1820  peptide ABC transporter ATP-binding protein SapF  50.99 
 
 
268 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  6.90889e-16 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2196  ABC transporter ATP-binding protein  45.24 
 
 
259 aa  260  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.936196  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2175  ABC transporter related  50.59 
 
 
268 aa  258  5.0000000000000005e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0158301 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0092  dipeptide transporter ATP-binding subunit  50.79 
 
 
358 aa  258  6e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4071  dipeptide transporter ATP-binding subunit  50.79 
 
 
358 aa  258  6e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4060  dipeptide transporter ATP-binding subunit  50.79 
 
 
358 aa  258  6e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3946  dipeptide transporter ATP-binding subunit  49.41 
 
 
337 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0840867  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3902  dipeptide transporter ATP-binding subunit  49.41 
 
 
337 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4006  dipeptide transporter ATP-binding subunit  49.41 
 
 
337 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3824  dipeptide transporter ATP-binding subunit  49.41 
 
 
337 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3838  dipeptide transporter ATP-binding subunit  49.41 
 
 
337 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3010  ABC transporter related  51.22 
 
 
261 aa  256  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4908  dipeptide transporter ATP-binding subunit  50 
 
 
334 aa  255  4e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3991  dipeptide transporter ATP-binding subunit  49.02 
 
 
334 aa  255  5e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03391  dipeptide transporter  49.02 
 
 
334 aa  254  8e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0172  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.02 
 
 
334 aa  254  8e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03342  hypothetical protein  49.02 
 
 
334 aa  254  8e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3859  dipeptide transporter ATP-binding subunit  49.6 
 
 
334 aa  254  8e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.712136  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4032  dipeptide transporter ATP-binding subunit  49.6 
 
 
334 aa  254  8e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3739  dipeptide transporter ATP-binding subunit  49.02 
 
 
334 aa  254  8e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0175  dipeptide transporter ATP-binding subunit  49.02 
 
 
334 aa  254  8e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0142  dipeptide transporter ATP-binding subunit  49.6 
 
 
329 aa  254  9e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0053  dipeptide transporter ATP-binding subunit  50.79 
 
 
336 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.146375  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0048  dipeptide transporter ATP-binding subunit  50.79 
 
 
336 aa  253  3e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0188  dipeptide transporter ATP-binding subunit  49.4 
 
 
337 aa  250  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0215713  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1748  ABC transporter related  49.41 
 
 
271 aa  249  4e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2346  ABC transporter related  49.41 
 
 
271 aa  248  7e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1714  ABC transporter related  49.01 
 
 
271 aa  248  8e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308855  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4094  dipeptide transporter ATP-binding subunit  49 
 
 
335 aa  247  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2617  ABC transporter related protein  49.41 
 
 
271 aa  246  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0151151  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1530  dipeptide transporter ATP-binding subunit  49.8 
 
 
343 aa  245  4.9999999999999997e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3903  dipeptide transporter ATP-binding subunit  48.61 
 
 
339 aa  245  6e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.62068  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2360  dipeptide transporter ATP-binding subunit  47.62 
 
 
344 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0186  dipeptide transporter ATP-binding subunit  48.39 
 
 
339 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1586  ABC transporter related  46.67 
 
 
282 aa  236  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.159648  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3750  dipeptide transporter ATP-binding subunit  47.58 
 
 
339 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.765741 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0486  dipeptide transporter ATP-binding subunit  44.14 
 
 
329 aa  234  7e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2051  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.09 
 
 
325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.953571  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12480  Oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding component  46.99 
 
 
319 aa  234  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0130592  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3783  ABC transporter related  46.09 
 
 
328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259832  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1582  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.67 
 
 
282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.322929  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  47.04 
 
 
623 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2910  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46 
 
 
345 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  46.64 
 
 
623 aa  233  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0590  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.2 
 
 
264 aa  233  3e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0442  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.6 
 
 
338 aa  231  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.530658  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0247  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.6 
 
 
338 aa  231  6e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.169504  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0260  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.6 
 
 
338 aa  231  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  46.25 
 
 
623 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  46.25 
 
 
623 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  46.25 
 
 
623 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  46.25 
 
 
612 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  46.64 
 
 
629 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  46.25 
 
 
612 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  46.25 
 
 
623 aa  231  8.000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3236  ABC peptide transporter, ATPase subunit  45.06 
 
 
282 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0755  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.18 
 
 
323 aa  230  1e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0800401 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02839  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.22 
 
 
267 aa  231  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3973  ABC transporter related  45.06 
 
 
282 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0224  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.2 
 
 
338 aa  230  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4242  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.85 
 
 
324 aa  229  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.410741  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0394  dipeptide transporter ATP-binding subunit  44.09 
 
 
317 aa  229  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.193411 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>