242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1598 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1598  lipoprotein ABC transporter permease  100 
 
 		 143 aa  291  2e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0677  lipoprotein ABC transporter permease  42.42 
 
 		 137 aa  107  6e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319442  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0367  N-terminal methylation  40.97 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1385  N- methylation  43.84 
 
 		 133 aa  101  3e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0320  N- methylation  44.62 
 
 		 141 aa  87.8  5e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0864  N-terminal methylation domain-containing protein  33.33 
 
 		 136 aa  76.6  0.00000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1183  N-terminal methylation domain protein  34.62 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1110  N-terminal methylation domain-containing protein  48.15 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.383546  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1109  hypothetical protein  63.27 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.925948  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1562  transformation system protein  66.67 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.586126  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0866  N-terminal methylation domain-containing protein  30.41 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.870147  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1565  N-terminal methylation domain-containing protein  63.83 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1599  N-terminal methylation domain-containing protein  74.36 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0100  N-terminal methylation domain-containing protein  76.92 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000252609  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0115  N-terminal methylation domain-containing protein  60.66 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1559  N-terminal methylation domain-containing protein  56.86 
 
 		 186 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.989333  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0706  hypothetical protein  29.32 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.769661  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1532  transformation system protein  47.17 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0367  transformation system protein  45.28 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1477  hypothetical protein  68.42 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.740331  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1478  hypothetical protein  68.42 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.930132  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1342  transformation system protein  47.17 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  44.62 
 
 		 182 aa  57  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1532  putative transformation system protein CtsG  62.86 
 
 		 190 aa  57  0.00000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0028  putative transformation system protein  64.1 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00183971  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0868  transformation system protein  51.11 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.371392  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  40.74 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  44.44 
 
 		 156 aa  53.5  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0464  hypothetical protein  38.71 
 
 		 191 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3217  hypothetical protein  42.67 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000170582 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2452  methylation site containing protein  46.43 
 
 		 197 aa  52  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00816638  normal  0.444869 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  45.16 
 
 		 192 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0448  hypothetical protein  45.16 
 
 		 191 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0837  N- methylation  78.57 
 
 		 232 aa  52  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.288173  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0568  methylation site containing protein  41.57 
 
 		 169 aa  51.6  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238644  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0573  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  38.37 
 
 		 166 aa  51.2  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.200044 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3983  methylation site containing protein  40.26 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3866  hypothetical protein  37.63 
 
 		 191 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4569  MSHA pilin protein MshA  46.88 
 
 		 187 aa  51.2  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442923  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  41.94 
 
 		 182 aa  50.8  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  42.59 
 
 		 140 aa  50.4  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  42.59 
 
 		 140 aa  50.4  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  38.89 
 
 		 150 aa  50.4  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1956  hypothetical protein  45.31 
 
 		 189 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0620526  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3689  pilin, putative  39.76 
 
 		 186 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  38.98 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3478  methylation site containing protein  32.85 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000141512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3074  pilin, putative  45.45 
 
 		 178 aa  48.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  28.33 
 
 		 171 aa  48.9  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  48.08 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1487  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  77.78 
 
 		 231 aa  48.5  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0048  pilin polypeptide PilA-like  48.98 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.335089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  35.63 
 
 		 193 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  37.74 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3326  pilin, putative  48.08 
 
 		 187 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0266287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1066  pilin, putative  45.45 
 
 		 187 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0964  pilin, putative  45.45 
 
 		 187 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0885526  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1033  pilin, putative  48.08 
 
 		 187 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0234716  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0049  pilin polypeptide PilA-like  48.98 
 
 		 144 aa  47  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0965276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  35.85 
 
 		 156 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  35.85 
 
 		 159 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0976  pilin, putative  41.82 
 
 		 180 aa  47.4  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0485556  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01338  hypothetical protein  32.98 
 
 		 195 aa  47  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3762  methylation site containing protein  28.45 
 
 		 202 aa  47  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000262752  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  32.23 
 
 		 129 aa  46.2  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0224  N- methylation  76.92 
 
 		 220 aa  46.6  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  36.54 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3781  hypothetical protein  45.28 
 
 		 172 aa  45.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  29.45 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  33.96 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  25.37 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0366  N-terminal methylation  75.86 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3989  pilin, putative  45.28 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2151  membrane protein  34.92 
 
 		 186 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4355  general secretion pathway protein G  38.89 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2521  hypothetical protein  36.56 
 
 		 193 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0754  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  52.63 
 
 		 195 aa  45.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.430859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3363  methylation  57.14 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57133  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0395  methylation site containing protein  28.83 
 
 		 211 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0635812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  32.08 
 
 		 154 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0516  methylation site containing protein  45.31 
 
 		 172 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00623258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1323  hypothetical protein  29.8 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0566  MSHA pilin protein MshB  28.97 
 
 		 205 aa  44.7  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.571105  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4570  MSHA pilin protein MshB  36.67 
 
 		 229 aa  44.7  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.527275  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0898  hypothetical protein  38.24 
 
 		 172 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0907  hypothetical protein  38.24 
 
 		 172 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3698  methylation site containing protein  44.44 
 
 		 192 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.452925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0872  hypothetical protein  38.24 
 
 		 172 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3464  hypothetical protein  38.24 
 
 		 172 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3828  methylation site containing protein  37.78 
 
 		 172 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000112537  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  42.31 
 
 		 164 aa  44.3  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  29.86 
 
 		 138 aa  44.7  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3520  methylation site containing protein  45.16 
 
 		 201 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0435  methylation site containing protein  45.16 
 
 		 201 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3690  methylation site containing protein  40 
 
 		 185 aa  44.3  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0865  N-terminal methylation domain-containing protein  41.54 
 
 		 253 aa  44.3  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  28.68 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3248  hypothetical protein  28.45 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1410  hypothetical protein  38.55 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0176  prepilin-type cleavage/methylation  32.79 
 
 		 212 aa  43.9  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>