249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0865 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0865  N-terminal methylation domain-containing protein  100 
 
 
253 aa  525  1e-148  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0866  N-terminal methylation domain-containing protein  38.1 
 
 
210 aa  122  6e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.870147  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0868  transformation system protein  61.54 
 
 
67 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.371392  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1385  N- methylation  46.67 
 
 
133 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1598  lipoprotein ABC transporter permease  41.54 
 
 
143 aa  62.4  0.000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1109  hypothetical protein  46.43 
 
 
153 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.925948  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0100  N-terminal methylation domain-containing protein  50.91 
 
 
170 aa  59.7  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000252609  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1559  N-terminal methylation domain-containing protein  42.86 
 
 
186 aa  59.3  0.00000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.989333  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0677  lipoprotein ABC transporter permease  50 
 
 
137 aa  59.3  0.00000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319442  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1562  transformation system protein  49.06 
 
 
187 aa  58.9  0.00000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.586126  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1565  N-terminal methylation domain-containing protein  42.86 
 
 
191 aa  58.5  0.00000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  47.17 
 
 
166 aa  58.2  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1599  N-terminal methylation domain-containing protein  35.44 
 
 
152 aa  57.4  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  41.82 
 
 
163 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  44.44 
 
 
145 aa  56.2  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  44.44 
 
 
145 aa  56.2  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  44.44 
 
 
145 aa  56.2  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0864  N-terminal methylation domain-containing protein  55.1 
 
 
136 aa  55.8  0.0000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  36.62 
 
 
192 aa  55.5  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0448  hypothetical protein  38.03 
 
 
191 aa  55.5  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4355  general secretion pathway protein G  42.11 
 
 
144 aa  55.5  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4731  general secretion pathway protein G  45.28 
 
 
144 aa  55.5  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0599807  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0464  hypothetical protein  29.09 
 
 
191 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  40 
 
 
146 aa  55.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  46.15 
 
 
144 aa  55.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  45.28 
 
 
144 aa  55.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  42.11 
 
 
144 aa  55.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  35.63 
 
 
182 aa  55.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  38.6 
 
 
156 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  45.45 
 
 
157 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  42.86 
 
 
146 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1278  general secretion pathway protein G  41.51 
 
 
147 aa  53.9  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  37.74 
 
 
156 aa  53.9  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3689  pilin, putative  38.89 
 
 
186 aa  54.3  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0320  N- methylation  45.83 
 
 
141 aa  54.3  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  34.48 
 
 
144 aa  54.3  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  39.62 
 
 
154 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  45.28 
 
 
144 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3074  pilin, putative  39.44 
 
 
178 aa  54.3  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  47.17 
 
 
153 aa  54.3  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  47.17 
 
 
150 aa  54.3  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  39.62 
 
 
159 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  42.11 
 
 
144 aa  53.9  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  40 
 
 
147 aa  53.5  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  43.4 
 
 
144 aa  53.5  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4248  general secretion pathway protein G  44.23 
 
 
148 aa  53.5  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0347967 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3312  general secretion pathway protein G  30.68 
 
 
138 aa  53.1  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  43.4 
 
 
144 aa  53.1  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4203  general secretion pathway protein G  43.4 
 
 
144 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  41.51 
 
 
140 aa  53.1  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  41.51 
 
 
140 aa  53.1  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  38.03 
 
 
185 aa  53.1  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  43.4 
 
 
144 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0592  general secretion pathway protein G  43.4 
 
 
147 aa  53.1  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  43.4 
 
 
144 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  43.4 
 
 
144 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  43.4 
 
 
144 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  43.4 
 
 
144 aa  53.1  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  43.4 
 
 
144 aa  53.1  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0156  general secretion pathway protein G  43.4 
 
 
144 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0156  general secretion pathway protein G  43.4 
 
 
144 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  40.38 
 
 
149 aa  52.8  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0605  general secretion pathway protein G  43.4 
 
 
147 aa  52.8  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000021872 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3866  hypothetical protein  28.18 
 
 
191 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  35.21 
 
 
144 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0172  general secretion pathway protein G  41.51 
 
 
143 aa  52.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2921  general secretion pathway protein G  44.23 
 
 
149 aa  52  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  40.68 
 
 
182 aa  52  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1956  hypothetical protein  38.03 
 
 
189 aa  52  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0620526  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  38.46 
 
 
156 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3989  pilin, putative  37.14 
 
 
187 aa  51.6  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0115  N-terminal methylation domain-containing protein  42.59 
 
 
135 aa  51.2  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  42.31 
 
 
146 aa  51.2  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  36.67 
 
 
149 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16150  General secretion pathway protein G  37.74 
 
 
145 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0976  pilin, putative  37.14 
 
 
180 aa  51.6  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0485556  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  42.31 
 
 
151 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  42.31 
 
 
151 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3690  methylation site containing protein  37.84 
 
 
185 aa  50.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1033  pilin, putative  35.9 
 
 
187 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0234716  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  42.31 
 
 
151 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  39.62 
 
 
150 aa  50.8  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0367  N-terminal methylation  39.34 
 
 
145 aa  50.8  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  42.31 
 
 
151 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0176  prepilin-type cleavage/methylation  37.31 
 
 
212 aa  50.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  42.31 
 
 
151 aa  50.8  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  33.33 
 
 
149 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  42.31 
 
 
151 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1066  pilin, putative  35.9 
 
 
187 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196226  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0964  pilin, putative  35.9 
 
 
187 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0885526  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4588  general secretion pathway protein G  38.89 
 
 
143 aa  50.4  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0367  transformation system protein  40.38 
 
 
169 aa  50.1  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  40.38 
 
 
142 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2452  methylation site containing protein  33.8 
 
 
197 aa  50.1  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00816638  normal  0.444869 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1110  N-terminal methylation domain-containing protein  38.33 
 
 
156 aa  50.1  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.383546  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  40.38 
 
 
148 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  50 
 
 
193 aa  50.1  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3217  hypothetical protein  33.73 
 
 
108 aa  50.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000170582 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0028  putative transformation system protein  45.24 
 
 
162 aa  50.1  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00183971  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3326  pilin, putative  37.14 
 
 
187 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0266287  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>