44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1264 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1264  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 536 aa  1096    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.908729  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1066  mechanosensitive ion channel family protein  55.53 
 
 		 528 aa  553  1e-156  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000663249  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0086  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  51.71 
 
 		 529 aa  552  1e-156  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00266935  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0855  mechanosensitive ion channel family protein  53.64 
 
 		 526 aa  540  9.999999999999999e-153  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1073  mechanosensitive ion channel family protein  52.83 
 
 		 535 aa  511  1e-143  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1021  MscS mechanosensitive ion channel  51.43 
 
 		 548 aa  508  9.999999999999999e-143  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.69997  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0697  mechanosensitive ion channel family protein  48.65 
 
 		 509 aa  456  1e-127  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1025  mechanosensitive ion channel family protein  48.09 
 
 		 523 aa  422  1e-117  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.902569  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1087  mechanosensitive ion channel family protein  49.06 
 
 		 523 aa  421  1e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0312609  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0782  mechanosensitive ion channel family protein  49.06 
 
 		 523 aa  421  1e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.916079  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1690  MscS mechanosensitive ion channel  28.04 
 
 		 476 aa  156  1e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1058  MscS Mechanosensitive ion channel  27.15 
 
 		 315 aa  120  9e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2824  MscS mechanosensitive ion channel  26.71 
 
 		 330 aa  108  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0786  MscS mechanosensitive ion channel  26.79 
 
 		 327 aa  107  7e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0154774  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0474  MscS mechanosensitive ion channel  28.41 
 
 		 320 aa  104  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08930  MscS Mechanosensitive ion channel  33.51 
 
 		 225 aa  104  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0434  MscS mechanosensitive ion channel  27.99 
 
 		 333 aa  94.4  5e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.302543  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2779  hypothetical protein  26.28 
 
 		 313 aa  94.4  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188203  normal  0.0353015 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4008  MscS mechanosensitive ion channel  22.59 
 
 		 583 aa  72  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2154  MscS Mechanosensitive ion channel  25.41 
 
 		 316 aa  63.2  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.568534  normal  0.399111 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3992  MscS Mechanosensitive ion channel  23.26 
 
 		 657 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.27926  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3884  LigA  21.96 
 
 		 667 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47617  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5647  MscS mechanosensitive ion channel  21.74 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.560781 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1508  MscS Mechanosensitive ion channel  26.71 
 
 		 301 aa  57  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0603757 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0259  MscS mechanosensitive ion channel  23.96 
 
 		 305 aa  53.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2854  MscS Mechanosensitive ion channel  23.66 
 
 		 314 aa  52.8  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.247394  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2755  MscS mechanosensitive ion channel:conserved TM helix  30 
 
 		 276 aa  51.6  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  20.11 
 
 		 389 aa  50.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08271  hypothetical protein  22.79 
 
 		 329 aa  50.1  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3016  MscS mechanosensitive ion channel  23.64 
 
 		 426 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0540  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  32 
 
 		 173 aa  48.1  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000231888  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  20.79 
 
 		 408 aa  48.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0987  MscS Mechanosensitive ion channel  26.76 
 
 		 238 aa  47.8  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2715  small-conductance mechanosensitive channel  25.93 
 
 		 270 aa  47.4  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2780  hypothetical protein  25.95 
 
 		 301 aa  47.4  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188886  normal  0.0383383 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  22.95 
 
 		 624 aa  46.6  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1640  mechanosensitive ion channel  31 
 
 		 173 aa  45.8  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0204845  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  26.92 
 
 		 274 aa  46.2  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1066  MscS Mechanosensitive ion channel  24.69 
 
 		 261 aa  46.2  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  24.07 
 
 		 282 aa  45.4  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000332583  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1220  MscS mechanosensitive ion channel  22.6 
 
 		 305 aa  45.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0859387 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1630  MscS Mechanosensitive ion channel  26.87 
 
 		 303 aa  45.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.131144 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02267  hypothetical protein  22.06 
 
 		 292 aa  45.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2895  helix-turn-helix, AraC type  25.13 
 
 		 264 aa  43.9  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0170548 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>