132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3627 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3627  hypothetical protein  100 
 
 
607 aa  1214    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2802  hypothetical protein  44.63 
 
 
598 aa  496  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.780991  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0040  protein of unknown function DUF1446  44.69 
 
 
616 aa  495  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.479807  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4459  hypothetical protein  47.56 
 
 
599 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3945  hypothetical protein  43.87 
 
 
596 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26750  hypothetical protein  44.18 
 
 
600 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0110  protein of unknown function DUF1446  46.88 
 
 
590 aa  488  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2689  hypothetical protein  43.19 
 
 
612 aa  479  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217964  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2268  hypothetical protein  43.34 
 
 
600 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1725  hypothetical protein  45.74 
 
 
627 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0106987  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0103  protein of unknown function DUF1446  45.84 
 
 
590 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0320  hypothetical protein  41.45 
 
 
603 aa  452  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2416  hypothetical protein  44.58 
 
 
571 aa  444  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.011341  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4188  hypothetical protein  41.92 
 
 
608 aa  438  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.217981  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2176  hypothetical protein  34.14 
 
 
596 aa  294  3e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6360  hypothetical protein  35.81 
 
 
619 aa  290  5.0000000000000004e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00827876  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4598  hypothetical protein  35.31 
 
 
578 aa  281  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4325  hypothetical protein  36.58 
 
 
562 aa  274  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3206  hypothetical protein  35.21 
 
 
574 aa  273  9e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.136417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3268  hypothetical protein  35.21 
 
 
574 aa  273  9e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133796  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3217  hypothetical protein  35.21 
 
 
574 aa  273  9e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.784644  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4846  hypothetical protein  33.95 
 
 
570 aa  272  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726466  normal  0.275126 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3831  protein of unknown function DUF1446  34.48 
 
 
587 aa  266  7e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0438804  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16490  Protein of unknown function (DUF1446)  34.93 
 
 
561 aa  261  2e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4765  hypothetical protein  36.06 
 
 
562 aa  261  3e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000030187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4431  protein of unknown function DUF1446  34.16 
 
 
581 aa  260  5.0000000000000005e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4684  hypothetical protein  33.82 
 
 
575 aa  260  6e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4304  hypothetical protein  33.82 
 
 
575 aa  259  9e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488796  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4390  hypothetical protein  33.82 
 
 
575 aa  259  9e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392949  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3735  protein of unknown function DUF1446  41.11 
 
 
451 aa  258  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4812  protein of unknown function DUF1446  41.11 
 
 
451 aa  258  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.532923  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4171  hypothetical protein  42.69 
 
 
445 aa  257  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2826  protein of unknown function DUF1446  34.8 
 
 
580 aa  256  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.125317  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4048  hypothetical protein  41.29 
 
 
445 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.905115 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3689  protein of unknown function DUF1446  40.19 
 
 
444 aa  252  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.539292  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3392  hypothetical protein  38.96 
 
 
450 aa  252  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.703348  normal  0.110524 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5610  hypothetical protein  39.9 
 
 
445 aa  249  9e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4555  hypothetical protein  33.72 
 
 
584 aa  249  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.655173  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0342  hypothetical protein  32.52 
 
 
587 aa  249  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1033  protein of unknown function DUF1446  33.78 
 
 
588 aa  249  1e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.62804  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10994  hypothetical protein  34.39 
 
 
560 aa  248  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.59299e-17  normal  0.631418 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6706  hypothetical protein  41.25 
 
 
444 aa  243  9e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0392889 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1910  protein of unknown function DUF1446  38.89 
 
 
450 aa  242  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1818  hypothetical protein  38.65 
 
 
450 aa  240  5e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1495  hypothetical protein  40.17 
 
 
454 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.123064  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4091  protein of unknown function DUF1446  38.39 
 
 
452 aa  237  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1164  hypothetical protein  37.32 
 
 
446 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.301898  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18500  Protein of unknown function (DUF1446)  38.14 
 
 
441 aa  234  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1885  hypothetical protein  33.28 
 
 
578 aa  234  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.181463 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0713  hypothetical protein  43.02 
 
 
482 aa  234  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3292  hypothetical protein  36.09 
 
 
452 aa  234  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1271  hypothetical protein  45.09 
 
 
453 aa  233  9e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.11625 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0886  hypothetical protein  40.34 
 
 
461 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1368  hypothetical protein  40.34 
 
 
461 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3167  protein of unknown function DUF1446  37.08 
 
 
446 aa  232  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0474207  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1245  hypothetical protein  41.06 
 
 
453 aa  229  8e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0825  hypothetical protein  35.4 
 
 
445 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.372095 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1346  hypothetical protein  40.34 
 
 
461 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0284571 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4625  hypothetical protein  38.22 
 
 
451 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6153  protein of unknown function DUF1446  32.33 
 
 
594 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.255067 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4511  hypothetical protein  39.33 
 
 
452 aa  226  8e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1474  hypothetical protein  36.97 
 
 
445 aa  226  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274913  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4610  hypothetical protein  34.36 
 
 
451 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6325  hypothetical protein  39.09 
 
 
452 aa  225  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.877291 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1227  hypothetical protein  33.77 
 
 
448 aa  223  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1939  hypothetical protein  37.92 
 
 
445 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  1.28662e-16  normal  0.114888 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1928  hypothetical protein  38.39 
 
 
453 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0148071 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3231  protein of unknown function DUF1446  35.11 
 
 
596 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.113119  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2673  hypothetical protein  34.47 
 
 
454 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0708192  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0976  hypothetical protein  38.94 
 
 
442 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643753  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4147  protein of unknown function DUF1446  33.19 
 
 
445 aa  213  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2761  hypothetical protein  38.42 
 
 
458 aa  212  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0046084  normal  0.122953 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2040  protein of unknown function DUF1446  41.78 
 
 
473 aa  213  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.378243  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0192  protein of unknown function DUF1446  38.48 
 
 
445 aa  211  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000279886  decreased coverage  0.000101954 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5398  hypothetical protein  41.57 
 
 
453 aa  209  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2111  hypothetical protein  35.52 
 
 
451 aa  209  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310455  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17100  hypothetical protein  41.4 
 
 
449 aa  193  7e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3666  protein of unknown function DUF1446  38.87 
 
 
443 aa  191  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5880  hypothetical protein  37.53 
 
 
466 aa  190  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06205  conserved hypothetical protein  27.37 
 
 
654 aa  183  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10086  DUF1446 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11420)  37.37 
 
 
587 aa  175  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.483728  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2041  hypothetical protein  38.46 
 
 
122 aa  77.8  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.448416  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4611  hypothetical protein  37.84 
 
 
116 aa  68.2  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775122  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0985  hypothetical protein  28.51 
 
 
452 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.961433 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1938  hypothetical protein  40 
 
 
108 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000407914  normal  0.0922297 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4626  hypothetical protein  34.23 
 
 
116 aa  64.3  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2112  hypothetical protein  31.58 
 
 
123 aa  62.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5881  hypothetical protein  37.04 
 
 
114 aa  62  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336106  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  34.91 
 
 
505 aa  61.6  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1272  hypothetical protein  37.74 
 
 
103 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.12483 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1720  hypothetical protein  27.31 
 
 
464 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.279763  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15420  hypothetical protein  24.55 
 
 
461 aa  60.8  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000364962  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3391  hypothetical protein  35.29 
 
 
130 aa  60.5  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.557296  normal  0.0862891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0486  hypothetical protein  28.57 
 
 
484 aa  60.5  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1367  hypothetical protein  36.19 
 
 
107 aa  60.5  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.948811 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1246  hypothetical protein  36.79 
 
 
103 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0191  hypothetical protein  35.24 
 
 
108 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.134855  hitchhiker  0.000327701 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2577  hypothetical protein  27 
 
 
469 aa  57.8  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2762  hypothetical protein  32.43 
 
 
121 aa  57.4  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0552602  normal  0.101389 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1927  hypothetical protein  35.92 
 
 
103 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.011093 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>