More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2934 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2934  hypothetical protein  100 
 
 		 466 aa  956    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.913582  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6051  hypothetical protein  65.07 
 
 		 466 aa  617  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6685  hypothetical protein  66.15 
 
 		 466 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6282  hypothetical protein  65.92 
 
 		 466 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0784  hypothetical protein  64.47 
 
 		 466 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6450  hypothetical protein  66.15 
 
 		 466 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6348  hypothetical protein  65.48 
 
 		 466 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0052  hypothetical protein  63.88 
 
 		 461 aa  610  1e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5629  hypothetical protein  64.35 
 
 		 467 aa  604  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6568  hypothetical protein  65.57 
 
 		 469 aa  598  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.475128 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6095  hypothetical protein  65.56 
 
 		 465 aa  597  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1489  hypothetical protein  65.78 
 
 		 465 aa  595  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.147981  hitchhiker  0.00313074 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2181  hypothetical protein  63.62 
 
 		 467 aa  593  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3065  hypothetical protein  60.31 
 
 		 459 aa  584  1.0000000000000001e-165  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0833151  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5596  hypothetical protein  59.78 
 
 		 458 aa  560  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.837363  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1583  aminotransferase class-III  59.91 
 
 		 452 aa  551  1e-156  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5668  hypothetical protein  60.22 
 
 		 457 aa  547  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4413  hypothetical protein  59.65 
 
 		 458 aa  542  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5008  hypothetical protein  59.56 
 
 		 458 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.375016 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6346  aminotransferase class-III  57.33 
 
 		 458 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.664852 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2912  hypothetical protein  61.4 
 
 		 457 aa  534  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4964  hypothetical protein  60.04 
 
 		 458 aa  515  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0693089  normal  0.0526808 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1920  hypothetical protein  58.99 
 
 		 458 aa  499  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  40.58 
 
 		 463 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  41.59 
 
 		 460 aa  351  2e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  43.72 
 
 		 457 aa  350  4e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  42.6 
 
 		 455 aa  350  4e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  41.35 
 
 		 470 aa  347  2e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  39.91 
 
 		 459 aa  346  5e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  39.96 
 
 		 466 aa  345  1e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  42.53 
 
 		 457 aa  342  8e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  41.21 
 
 		 453 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  41.11 
 
 		 454 aa  339  7e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  41.69 
 
 		 453 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  41.69 
 
 		 453 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  40.13 
 
 		 456 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  41.46 
 
 		 453 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  40.27 
 
 		 459 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  42.4 
 
 		 452 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  40.27 
 
 		 470 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  40.17 
 
 		 456 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  40.17 
 
 		 456 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  41.72 
 
 		 452 aa  334  3e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2986  putative aminotransferase  40.3 
 
 		 465 aa  332  6e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2046  hypothetical protein  40 
 
 		 470 aa  332  9e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.990392  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3718  hypothetical protein  39.59 
 
 		 470 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319896  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  41.26 
 
 		 458 aa  330  2e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  41.72 
 
 		 452 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  40.54 
 
 		 454 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  40.58 
 
 		 455 aa  329  6e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  38.84 
 
 		 471 aa  328  9e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  40.17 
 
 		 456 aa  327  4.0000000000000003e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0851  hypothetical protein  39.74 
 
 		 460 aa  325  8.000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718133  normal  0.0976867 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  39.59 
 
 		 460 aa  323  3e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  38.86 
 
 		 456 aa  323  3e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  39.27 
 
 		 460 aa  323  5e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  36.36 
 
 		 467 aa  321  9.999999999999999e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  39.42 
 
 		 457 aa  322  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2691  hypothetical protein  38.9 
 
 		 457 aa  320  3e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63500  hypothetical protein  39.22 
 
 		 468 aa  319  6e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.711266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  38.68 
 
 		 458 aa  318  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  39.56 
 
 		 460 aa  318  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  38.82 
 
 		 457 aa  317  4e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  38.75 
 
 		 455 aa  316  6e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  38.63 
 
 		 468 aa  315  8e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  36.17 
 
 		 467 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  37.04 
 
 		 466 aa  313  3.9999999999999997e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  39 
 
 		 456 aa  313  5.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  37.31 
 
 		 465 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5799  hypothetical protein  38.41 
 
 		 464 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267871  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6163  hypothetical protein  38.41 
 
 		 464 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  37.22 
 
 		 459 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  37.61 
 
 		 459 aa  310  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  37.5 
 
 		 451 aa  310  5e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  37 
 
 		 451 aa  310  5e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  38.5 
 
 		 463 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0797  aminotransferase class-III  35.56 
 
 		 461 aa  309  6.999999999999999e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5513  aminotransferase class-III  36.91 
 
 		 460 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574518  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  38.55 
 
 		 458 aa  308  1.0000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5780  hypothetical protein  38.41 
 
 		 464 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1108  putative aminotransferase  38.37 
 
 		 465 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6024  hypothetical protein  37.97 
 
 		 464 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6644  hypothetical protein  37.75 
 
 		 464 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  39.38 
 
 		 455 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  36.15 
 
 		 443 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0161  hypothetical protein  37.96 
 
 		 463 aa  304  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  38.04 
 
 		 485 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  37.2 
 
 		 451 aa  303  4.0000000000000003e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  36.4 
 
 		 469 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3814  aminotransferase class-III  37.39 
 
 		 460 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1185  hypothetical protein  37.07 
 
 		 465 aa  302  9e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.932447  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  36.18 
 
 		 468 aa  302  9e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4500  hypothetical protein  39.58 
 
 		 444 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6140  hypothetical protein  37.34 
 
 		 464 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0159356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2989  putative aminotransferase  38.39 
 
 		 475 aa  301  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2799  aminotransferase  37.33 
 
 		 459 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.707111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2078  putative aminotransferase  37.2 
 
 		 461 aa  300  5e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5915  putative aminotransferase  36.82 
 
 		 464 aa  300  5e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2162  putative aminotransferase  36.82 
 
 		 464 aa  300  5e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  36.67 
 
 		 456 aa  298  1e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>