59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2167 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2167  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  765    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5381  TraF-like protein  59.64 
 
 		 271 aa  291  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.342632 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3996  hypothetical protein  56.95 
 
 		 270 aa  274  1.0000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5377  TraU family protein  65.99 
 
 		 340 aa  193  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.96345 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4000  TraU family protein  60.16 
 
 		 340 aa  165  9e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4169  hypothetical protein  29.6 
 
 		 270 aa  124  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.347848 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2329  hypothetical protein  31.15 
 
 		 287 aa  122  8e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.370082  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6813  hypothetical protein  30.57 
 
 		 269 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0023  hypothetical protein  49.57 
 
 		 327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.621919  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2662  hypothetical protein  30.04 
 
 		 288 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.685452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4174  TraU family protein  43.66 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.109495 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1526  hypothetical protein  34.03 
 
 		 291 aa  114  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00702216  normal  0.485209 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0031  hypothetical protein  39.74 
 
 		 331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.957348  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4231  hypothetical protein  48.31 
 
 		 328 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4235  hypothetical protein  27.12 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4624  TraU family protein  41.94 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4532  TraU family protein  41.94 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4381  TraU family protein  41.94 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4439  TraU family protein  41.94 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4435  TraU family protein  41.94 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6806  TraU family protein  38.78 
 
 		 343 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0026  conjugal transfer pilus assembly protein TraU  42.97 
 
 		 330 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2325  hypothetical protein  45.19 
 
 		 342 aa  104  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.133454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4296  conjugal transfer pilus assembly protein TraU  40 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.973053 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_11  conjugative transfer protein TraU  39.71 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2658  hypothetical protein  45.24 
 
 		 342 aa  102  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.274571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4505  TraU family protein  41.91 
 
 		 335 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4299  conjugal pilus assembly protein TraF  30.32 
 
 		 261 aa  93.6  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420185 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1530  TraU family protein  51.22 
 
 		 341 aa  91.7  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.283148  normal  0.998199 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0187  type IV conjugative transfer system protein TraF  29.05 
 
 		 342 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00056755 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0020  conjugal pilus assembly protein TraF  29.25 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.458237  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0034  hypothetical protein  27.03 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0249  TraU family protein  32.64 
 
 		 340 aa  79.3  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0311  TraU family protein  31.91 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6222  sex pilus assembly protein  29.91 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.641556  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0026  conjugal pilus assembly protein TraF  22.87 
 
 		 246 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.366361  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_14  conjugative transfer protein TraF  25.11 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4270  hypothetical protein  26.85 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000107556  normal  0.839186 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6167  sex pilus assembly and synthesis protein TraU  40.91 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0349  conjugal DNA transfer protein  37.14 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1066  pilus assembly protein TraF, putative  24.76 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.525771  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0374  sex pilus assembly protein  27.12 
 
 		 317 aa  65.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0197  glutaredoxin 2  28.65 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6232  TraU family protein  39.25 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2124  thioredoxin domain-containing protein  28.65 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0252  glutaredoxin 2  28.65 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3772  TraU family protein  33.9 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3800  glutaredoxin  26.11 
 
 		 280 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4384  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  23.56 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0100  type IV conjugative transfer system protein TraU  33.33 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.185044 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4621  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  23.56 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4432  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  23.11 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4529  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  23.11 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.92832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4508  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  23.11 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4436  Type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  25.49 
 
 		 291 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0035  hypothetical protein  27.91 
 
 		 165 aa  53.1  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0027  hypothetical protein  26.67 
 
 		 168 aa  52.8  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.520271  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4207  TraU family protein  34.15 
 
 		 359 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00154228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1096  conjugal transfer protein TraU, putative  28.24 
 
 		 416 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.952693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>