24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpp0034 on replicon NC_006365
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006365  plpp0034  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  542  1e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4299  conjugal pilus assembly protein TraF  30.86 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420185 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0020  conjugal pilus assembly protein TraF  29.69 
 
 		 247 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.458237  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0026  conjugal pilus assembly protein TraF  28.92 
 
 		 246 aa  93.6  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.366361  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_14  conjugative transfer protein TraF  25.97 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5381  TraF-like protein  27.06 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.342632 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4169  hypothetical protein  24.19 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.347848 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2167  hypothetical protein  26.6 
 
 		 371 aa  73.2  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2329  hypothetical protein  26.38 
 
 		 287 aa  72  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.370082  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2662  hypothetical protein  26.27 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.685452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3996  hypothetical protein  26.34 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6813  hypothetical protein  24.73 
 
 		 269 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1526  hypothetical protein  25.91 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00702216  normal  0.485209 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4436  Type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  23.02 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4529  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  23.28 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.92832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4384  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  22.81 
 
 		 291 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4432  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  22.9 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4621  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  22.66 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4508  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  22.22 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4235  hypothetical protein  24.51 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0197  glutaredoxin 2  22.22 
 
 		 279 aa  45.8  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0252  glutaredoxin 2  21.84 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4270  hypothetical protein  23.21 
 
 		 331 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000107556  normal  0.839186 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0035  hypothetical protein  27.59 
 
 		 165 aa  42.4  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>