43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1526 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1526  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  589  1e-167  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00702216  normal  0.485209 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2329  hypothetical protein  74.81 
 
 
287 aa  401  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.370082  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2662  hypothetical protein  69.97 
 
 
288 aa  399  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.685452  normal 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4169  hypothetical protein  34.77 
 
 
270 aa  166  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.347848 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6813  hypothetical protein  36.36 
 
 
269 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5381  TraF-like protein  35.96 
 
 
271 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.342632 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3996  hypothetical protein  34.31 
 
 
270 aa  129  7.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2167  hypothetical protein  34.2 
 
 
371 aa  113  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0187  type IV conjugative transfer system protein TraF  31.73 
 
 
342 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00056755 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4235  hypothetical protein  31.8 
 
 
277 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4299  conjugal pilus assembly protein TraF  27.12 
 
 
261 aa  96.7  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.420185 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4508  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  28.14 
 
 
291 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0020  conjugal pilus assembly protein TraF  28.76 
 
 
247 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.458237  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4621  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  27.71 
 
 
291 aa  89  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_14  conjugative transfer protein TraF  27.07 
 
 
247 aa  89  9e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4384  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  27.71 
 
 
291 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4432  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  27.71 
 
 
291 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4529  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  27.71 
 
 
291 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.92832  normal 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0026  conjugal pilus assembly protein TraF  29.44 
 
 
246 aa  87.4  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.366361  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4436  Type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  27.71 
 
 
291 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4270  hypothetical protein  25.78 
 
 
331 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000107556  normal  0.839186 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0034  hypothetical protein  25.33 
 
 
262 aa  75.9  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0197  glutaredoxin 2  25.51 
 
 
279 aa  75.5  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0252  glutaredoxin 2  25.51 
 
 
278 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6222  sex pilus assembly protein  28.08 
 
 
338 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.641556  normal 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0027  hypothetical protein  30.25 
 
 
168 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.520271  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0374  sex pilus assembly protein  25.91 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2124  thioredoxin domain-containing protein  25.11 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_16  conjugative transfer protein TrbB  34.69 
 
 
141 aa  64.3  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0035  hypothetical protein  30.15 
 
 
165 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1066  pilus assembly protein TraF, putative  22.82 
 
 
337 aa  63.5  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.525771  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4434  Type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  37.5 
 
 
147 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4510  type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  36.46 
 
 
147 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.993291  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4620  type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  36.46 
 
 
145 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4528  type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  36.46 
 
 
145 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.372665  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4385  type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  36.46 
 
 
145 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4430  type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  36.46 
 
 
147 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.462395  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3800  glutaredoxin  22.03 
 
 
280 aa  56.6  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0974  hypothetical protein  22.13 
 
 
257 aa  44.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.455513  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0017  conjugal transfer protein TrbB  35.29 
 
 
181 aa  43.5  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412477  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0894  thioredoxin 1  34.02 
 
 
102 aa  42.7  0.007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0704884  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0850  Thioredoxin domain protein  24.55 
 
 
110 aa  42.7  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190826  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4277  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.69 
 
 
488 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>