40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0197 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0197  glutaredoxin 2  100 
 
 		 279 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0252  glutaredoxin 2  98.57 
 
 		 278 aa  529  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2124  thioredoxin domain-containing protein  88.53 
 
 		 279 aa  496  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3800  glutaredoxin  48.03 
 
 		 280 aa  290  2e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2662  hypothetical protein  24.22 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.685452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2329  hypothetical protein  25.94 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.370082  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1526  hypothetical protein  25.1 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00702216  normal  0.485209 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3996  hypothetical protein  23.85 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5381  TraF-like protein  23.89 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.342632 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2167  hypothetical protein  28.65 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4169  hypothetical protein  27.04 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.347848 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4235  hypothetical protein  21.82 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4270  hypothetical protein  24.9 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000107556  normal  0.839186 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6813  hypothetical protein  27.42 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0034  hypothetical protein  23.94 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6222  sex pilus assembly protein  23.4 
 
 		 338 aa  52.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.641556  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0026  conjugal pilus assembly protein TraF  23.89 
 
 		 246 aa  49.3  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.366361  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0374  sex pilus assembly protein  20.75 
 
 		 317 aa  47.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0554  glutaredoxin-like domain-containing protein  34 
 
 		 220 aa  48.1  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.411962  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0974  hypothetical protein  21.99 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.455513  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1066  pilus assembly protein TraF, putative  21.24 
 
 		 337 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.525771  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0187  type IV conjugative transfer system protein TraF  20.23 
 
 		 342 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00056755 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5187  Thioredoxin domain protein  33.33 
 
 		 116 aa  46.2  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4529  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  23.27 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.92832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4432  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  23.27 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  32.1 
 
 		 105 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4621  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  22.04 
 
 		 291 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  30 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1697  thioredoxin domain-containing protein  28.17 
 
 		 115 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  25.27 
 
 		 304 aa  43.5  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  25.62 
 
 		 302 aa  43.9  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4384  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  22.04 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4508  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  22.18 
 
 		 291 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  29.63 
 
 		 104 aa  43.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  31.76 
 
 		 98 aa  42.7  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4436  Type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  22.04 
 
 		 291 aa  42.7  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0162  thioredoxin domain protein  33.82 
 
 		 129 aa  42.7  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.142979  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  27.38 
 
 		 302 aa  42.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0020  conjugal pilus assembly protein TraF  20.63 
 
 		 247 aa  42.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.458237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  29.51 
 
 		 257 aa  42.4  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0521557 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>