28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0374 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0374  sex pilus assembly protein  100 
 
 		 317 aa  651    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1066  pilus assembly protein TraF, putative  29.03 
 
 		 337 aa  153  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.525771  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6222  sex pilus assembly protein  33.87 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.641556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0187  type IV conjugative transfer system protein TraF  30.84 
 
 		 342 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00056755 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4270  hypothetical protein  27.46 
 
 		 331 aa  107  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000107556  normal  0.839186 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4169  hypothetical protein  26.22 
 
 		 270 aa  87.4  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.347848 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5381  TraF-like protein  26.24 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.342632 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6813  hypothetical protein  25.79 
 
 		 269 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2662  hypothetical protein  26.38 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.685452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2329  hypothetical protein  26.37 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.370082  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4235  hypothetical protein  24.69 
 
 		 277 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3996  hypothetical protein  26.84 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1526  hypothetical protein  25.9 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00702216  normal  0.485209 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4432  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  26.84 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4529  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  26.84 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.92832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4384  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  26.84 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4299  conjugal pilus assembly protein TraF  24.71 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420185 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4621  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  26.84 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4508  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  26.41 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4436  Type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  24.78 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2167  hypothetical protein  26.23 
 
 		 371 aa  65.9  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_14  conjugative transfer protein TraF  24.24 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2124  thioredoxin domain-containing protein  21.54 
 
 		 279 aa  53.1  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0197  glutaredoxin 2  21.14 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0252  glutaredoxin 2  21.14 
 
 		 278 aa  52  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3800  glutaredoxin  20 
 
 		 280 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0026  conjugal pilus assembly protein TraF  20.09 
 
 		 246 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.366361  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0020  conjugal pilus assembly protein TraF  23.58 
 
 		 247 aa  42.7  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.458237  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>