18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_6222 on replicon NC_010070
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010070  Bmul_6222  sex pilus assembly protein  100 
 
 
338 aa  691    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.641556  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0374  sex pilus assembly protein  36.04 
 
 
317 aa  136  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1066  pilus assembly protein TraF, putative  25.1 
 
 
337 aa  101  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.525771  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0187  type IV conjugative transfer system protein TraF  25.76 
 
 
342 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00056755 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4270  hypothetical protein  22.73 
 
 
331 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000107556  normal  0.839186 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5381  TraF-like protein  25.91 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.342632 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4169  hypothetical protein  25.79 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.347848 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2167  hypothetical protein  29.5 
 
 
371 aa  69.7  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3996  hypothetical protein  29.14 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2329  hypothetical protein  27.53 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.370082  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2662  hypothetical protein  26.83 
 
 
288 aa  67  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.685452  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1526  hypothetical protein  28.86 
 
 
291 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00702216  normal  0.485209 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4235  hypothetical protein  26.97 
 
 
277 aa  60.1  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6813  hypothetical protein  24.29 
 
 
269 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4299  conjugal pilus assembly protein TraF  26.74 
 
 
261 aa  55.8  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.420185 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0252  glutaredoxin 2  24 
 
 
278 aa  53.1  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2124  thioredoxin domain-containing protein  25.28 
 
 
279 aa  50.8  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0197  glutaredoxin 2  24.72 
 
 
279 aa  49.3  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>