31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_pSN254_0187 on replicon NC_009140
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009140  SNSL254_pSN254_0187  type IV conjugative transfer system protein TraF  100 
 
 		 342 aa  699    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00056755 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4270  hypothetical protein  31.23 
 
 		 331 aa  139  6e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000107556  normal  0.839186 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0374  sex pilus assembly protein  30.4 
 
 		 317 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2329  hypothetical protein  30.74 
 
 		 287 aa  114  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.370082  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2662  hypothetical protein  30.26 
 
 		 288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.685452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4169  hypothetical protein  30.92 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.347848 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6813  hypothetical protein  34.22 
 
 		 269 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3996  hypothetical protein  29.43 
 
 		 270 aa  100  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1526  hypothetical protein  29.89 
 
 		 291 aa  99.8  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00702216  normal  0.485209 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1066  pilus assembly protein TraF, putative  26.71 
 
 		 337 aa  97.1  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.525771  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5381  TraF-like protein  29.69 
 
 		 271 aa  97.1  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.342632 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6222  sex pilus assembly protein  25 
 
 		 338 aa  87  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.641556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4299  conjugal pilus assembly protein TraF  28.87 
 
 		 261 aa  85.9  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420185 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2167  hypothetical protein  27.5 
 
 		 371 aa  85.9  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0020  conjugal pilus assembly protein TraF  27.54 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.458237  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0026  conjugal pilus assembly protein TraF  23.04 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.366361  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4621  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  25.27 
 
 		 291 aa  67  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4436  Type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  25.27 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4508  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  25.27 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4432  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  24.91 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4384  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  24.91 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4529  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  24.91 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.92832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4235  hypothetical protein  27.14 
 
 		 277 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_14  conjugative transfer protein TraF  23.33 
 
 		 247 aa  54.7  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0034  hypothetical protein  25.46 
 
 		 262 aa  47  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3800  glutaredoxin  22.06 
 
 		 280 aa  46.2  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0252  glutaredoxin 2  20.86 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0197  glutaredoxin 2  20.86 
 
 		 279 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0974  hypothetical protein  26.61 
 
 		 257 aa  45.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.455513  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0027  hypothetical protein  30 
 
 		 168 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.520271  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2124  thioredoxin domain-containing protein  21.29 
 
 		 279 aa  43.5  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>