28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3800 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008607  Ppro_3800  glutaredoxin  100 
 
 		 280 aa  584  1e-166  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0252  glutaredoxin 2  47.65 
 
 		 278 aa  281  6.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0197  glutaredoxin 2  47.65 
 
 		 279 aa  281  8.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2124  thioredoxin domain-containing protein  48.19 
 
 		 279 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5381  TraF-like protein  25.96 
 
 		 271 aa  65.5  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.342632 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2167  hypothetical protein  26.11 
 
 		 371 aa  58.9  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3996  hypothetical protein  22.13 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0974  hypothetical protein  21.91 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.455513  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2329  hypothetical protein  19.92 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.370082  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2662  hypothetical protein  19.84 
 
 		 288 aa  50.4  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.685452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4169  hypothetical protein  22.41 
 
 		 270 aa  50.8  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.347848 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4235  hypothetical protein  21.57 
 
 		 277 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4290  Thioredoxin domain protein  28.57 
 
 		 123 aa  49.7  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3714  Thioredoxin domain protein  29.85 
 
 		 143 aa  49.7  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4621  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  23.62 
 
 		 291 aa  49.3  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1526  hypothetical protein  23.2 
 
 		 291 aa  49.3  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00702216  normal  0.485209 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4384  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  23.62 
 
 		 291 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0026  conjugal pilus assembly protein TraF  21.48 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.366361  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3383  Thioredoxin domain protein  32.31 
 
 		 123 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.346342  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4436  Type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  22.83 
 
 		 291 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4529  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  22.83 
 
 		 291 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.92832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4432  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  22.83 
 
 		 291 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4508  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  22.83 
 
 		 291 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5187  Thioredoxin domain protein  30.3 
 
 		 116 aa  46.6  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  31.34 
 
 		 120 aa  44.3  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0459  Thioredoxin domain protein  27.85 
 
 		 118 aa  43.9  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0621095  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  27.27 
 
 		 119 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  35 
 
 		 88 aa  43.5  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>