24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4529 on replicon NC_009998
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011668  Sbal223_4432  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  99.66 
 
 		 291 aa  603  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4529  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  100 
 
 		 291 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.92832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4384  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  97.25 
 
 		 291 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4621  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  96.91 
 
 		 291 aa  587  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4508  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  96.56 
 
 		 291 aa  584  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4436  Type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  96.91 
 
 		 291 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_14  conjugative transfer protein TraF  55.24 
 
 		 247 aa  278  1e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4299  conjugal pilus assembly protein TraF  32.03 
 
 		 261 aa  122  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420185 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0020  conjugal pilus assembly protein TraF  31.91 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.458237  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0026  conjugal pilus assembly protein TraF  27.2 
 
 		 246 aa  96.7  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.366361  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2662  hypothetical protein  27.37 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.685452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2329  hypothetical protein  27.21 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.370082  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1526  hypothetical protein  28.73 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00702216  normal  0.485209 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4169  hypothetical protein  24.54 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.347848 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6813  hypothetical protein  28.22 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0034  hypothetical protein  23.28 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5381  TraF-like protein  24.34 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.342632 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4235  hypothetical protein  25.43 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3996  hypothetical protein  22.87 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0374  sex pilus assembly protein  25.42 
 
 		 317 aa  57  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2167  hypothetical protein  25.49 
 
 		 371 aa  54.3  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0187  type IV conjugative transfer system protein TraF  23.81 
 
 		 342 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00056755 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4270  hypothetical protein  22.06 
 
 		 331 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000107556  normal  0.839186 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1066  pilus assembly protein TraF, putative  23.11 
 
 		 337 aa  49.3  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.525771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>