42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4169 on replicon NC_008765
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008765  Ajs_4169  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  563  1e-160  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.347848 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6813  hypothetical protein  52.87 
 
 		 269 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2662  hypothetical protein  32.82 
 
 		 288 aa  168  8e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.685452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2329  hypothetical protein  33.2 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.370082  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1526  hypothetical protein  37.63 
 
 		 291 aa  156  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00702216  normal  0.485209 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5381  TraF-like protein  32.91 
 
 		 271 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.342632 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3996  hypothetical protein  32.35 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2167  hypothetical protein  28.72 
 
 		 371 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0187  type IV conjugative transfer system protein TraF  33.18 
 
 		 342 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00056755 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0026  conjugal pilus assembly protein TraF  26.74 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.366361  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4235  hypothetical protein  25.83 
 
 		 277 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4299  conjugal pilus assembly protein TraF  26.27 
 
 		 261 aa  89.7  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420185 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4270  hypothetical protein  25.69 
 
 		 331 aa  86.3  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000107556  normal  0.839186 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0020  conjugal pilus assembly protein TraF  24.42 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.458237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0374  sex pilus assembly protein  25.95 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0034  hypothetical protein  23.88 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_14  conjugative transfer protein TraF  22.83 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0027  hypothetical protein  41.38 
 
 		 168 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.520271  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4432  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  23.77 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4529  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  23.77 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.92832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4384  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  23.4 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4621  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  24.25 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6222  sex pilus assembly protein  26.22 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.641556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4508  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  24.25 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4436  Type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  24.25 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0197  glutaredoxin 2  27.04 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0252  glutaredoxin 2  27.87 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2124  thioredoxin domain-containing protein  26.4 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_16  conjugative transfer protein TrbB  32.98 
 
 		 141 aa  62  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4434  Type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  40 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4620  type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  37.97 
 
 		 145 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4528  type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  37.97 
 
 		 145 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.372665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4385  type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  37.97 
 
 		 145 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4510  type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  37.5 
 
 		 147 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.993291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4430  type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  37.5 
 
 		 147 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.462395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1066  pilus assembly protein TraF, putative  27.69 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.525771  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0035  hypothetical protein  30.7 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3800  glutaredoxin  22.96 
 
 		 280 aa  52.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0017  conjugal transfer protein TrbB  43.18 
 
 		 181 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4301  conjugal transfer protein TrbB  27.1 
 
 		 200 aa  44.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.434158  normal  0.256366 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0759  putative suppressor for copper-sensitivity D  23.74 
 
 		 178 aa  43.5  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1313  Redoxin domain protein  26.15 
 
 		 182 aa  42.7  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000515497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>