37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2124 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2124  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 279 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0197  glutaredoxin 2  90.58 
 
 		 279 aa  494  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0252  glutaredoxin 2  90.48 
 
 		 278 aa  487  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3800  glutaredoxin  48.19 
 
 		 280 aa  287  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2662  hypothetical protein  24.79 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.685452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2329  hypothetical protein  24.79 
 
 		 287 aa  75.5  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.370082  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3996  hypothetical protein  25.2 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5381  TraF-like protein  25.75 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.342632 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1526  hypothetical protein  25.52 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00702216  normal  0.485209 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2167  hypothetical protein  28.65 
 
 		 371 aa  65.9  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4169  hypothetical protein  26.4 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.347848 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6222  sex pilus assembly protein  23.85 
 
 		 338 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.641556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6813  hypothetical protein  25.27 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4235  hypothetical protein  21.38 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0026  conjugal pilus assembly protein TraF  24.32 
 
 		 246 aa  53.5  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.366361  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4270  hypothetical protein  23.51 
 
 		 331 aa  52.8  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000107556  normal  0.839186 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0034  hypothetical protein  22.13 
 
 		 262 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0554  glutaredoxin-like domain-containing protein  33 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.411962  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1066  pilus assembly protein TraF, putative  22.67 
 
 		 337 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.525771  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5187  Thioredoxin domain protein  34.85 
 
 		 116 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4299  conjugal pilus assembly protein TraF  19.57 
 
 		 261 aa  46.6  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420185 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0374  sex pilus assembly protein  20.42 
 
 		 317 aa  46.2  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4529  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  21.99 
 
 		 291 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.92832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4432  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  21.34 
 
 		 291 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0187  type IV conjugative transfer system protein TraF  20.23 
 
 		 342 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00056755 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  34.57 
 
 		 105 aa  45.8  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0020  conjugal pilus assembly protein TraF  21.05 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.458237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4384  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  20.92 
 
 		 291 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  36.36 
 
 		 113 aa  43.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4621  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  20.92 
 
 		 291 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0974  hypothetical protein  21.61 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.455513  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1697  thioredoxin domain-containing protein  24.66 
 
 		 115 aa  42.7  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  28.72 
 
 		 119 aa  42.7  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  32.5 
 
 		 269 aa  42.4  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  27.27 
 
 		 302 aa  42.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4508  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  20.5 
 
 		 291 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  27.47 
 
 		 304 aa  42  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>