25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpl0027 on replicon NC_006366
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006366  plpl0027  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  348  3e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.520271  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4169  hypothetical protein  41.51 
 
 		 270 aa  74.7  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.347848 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5381  TraF-like protein  30.53 
 
 		 271 aa  73.9  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.342632 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1526  hypothetical protein  30.25 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00702216  normal  0.485209 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2662  hypothetical protein  35.58 
 
 		 288 aa  70.9  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.685452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2329  hypothetical protein  35.58 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.370082  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6813  hypothetical protein  32.48 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0035  hypothetical protein  28.57 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_16  conjugative transfer protein TrbB  30 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3996  hypothetical protein  29.9 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4434  Type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  34.74 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4510  type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  34.74 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.993291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4385  type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  34.74 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4620  type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  34.74 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4528  type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  34.74 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.372665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4430  type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  34.74 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.462395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4301  conjugal transfer protein TrbB  35.04 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.434158  normal  0.256366 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0026  conjugal pilus assembly protein TraF  26.09 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.366361  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0017  conjugal transfer protein TrbB  30.3 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2167  hypothetical protein  26.67 
 
 		 371 aa  53.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4299  conjugal pilus assembly protein TraF  25.83 
 
 		 261 aa  50.8  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420185 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1975  DSBA oxidoreductase  24.68 
 
 		 215 aa  45.8  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0187  type IV conjugative transfer system protein TraF  30 
 
 		 342 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00056755 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4270  hypothetical protein  29.52 
 
 		 331 aa  44.3  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000107556  normal  0.839186 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1684  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 215 aa  41.6  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>