20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpp0035 on replicon NC_006365
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006365  plpp0035  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  340  4e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_16  conjugative transfer protein TrbB  34.58 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1526  hypothetical protein  32 
 
 		 291 aa  65.1  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00702216  normal  0.485209 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2662  hypothetical protein  35.78 
 
 		 288 aa  64.3  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.685452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2329  hypothetical protein  35.78 
 
 		 287 aa  64.3  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.370082  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0027  hypothetical protein  28.57 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.520271  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4430  type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  31.78 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.462395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4434  Type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  30.84 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4528  type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  31.37 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.372665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4620  type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  31.37 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0017  conjugal transfer protein TrbB  31.62 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4385  type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  31.37 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6813  hypothetical protein  30.3 
 
 		 269 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4510  type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  29.91 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.993291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4169  hypothetical protein  30.7 
 
 		 270 aa  54.7  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.347848 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2167  hypothetical protein  28.69 
 
 		 371 aa  53.9  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0026  conjugal pilus assembly protein TraF  28.21 
 
 		 246 aa  49.7  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.366361  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3996  hypothetical protein  26.96 
 
 		 270 aa  44.7  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5381  TraF-like protein  24.77 
 
 		 271 aa  43.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.342632 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0034  hypothetical protein  27.59 
 
 		 262 aa  42.4  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>