18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_4434 on replicon NC_009661
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009661  Shew185_4434  Type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  100 
 
 		 147 aa  301  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4510  type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  97.96 
 
 		 147 aa  297  4e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.993291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4430  type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  97.96 
 
 		 147 aa  295  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.462395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4385  type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  83.67 
 
 		 145 aa  249  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4620  type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  83.67 
 
 		 145 aa  249  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4528  type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  83.67 
 
 		 145 aa  249  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.372665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_16  conjugative transfer protein TrbB  58.77 
 
 		 141 aa  150  7e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0017  conjugal transfer protein TrbB  46.15 
 
 		 181 aa  83.6  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1526  hypothetical protein  35.78 
 
 		 291 aa  63.9  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00702216  normal  0.485209 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4301  conjugal transfer protein TrbB  33.33 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.434158  normal  0.256366 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2662  hypothetical protein  35.96 
 
 		 288 aa  61.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.685452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2329  hypothetical protein  36.04 
 
 		 287 aa  61.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.370082  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4169  hypothetical protein  38.75 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.347848 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0027  hypothetical protein  34.74 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.520271  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0035  hypothetical protein  30.84 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6813  hypothetical protein  33 
 
 		 269 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0622  twin-arginine translocation pathway signal  38.6 
 
 		 233 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  42.5 
 
 		 222 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>