19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_A0017 on replicon NC_010488
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010488  EcSMS35_A0017  conjugal transfer protein TrbB  100 
 
 		 181 aa  372  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4301  conjugal transfer protein TrbB  38.76 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.434158  normal  0.256366 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4434  Type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  46.15 
 
 		 147 aa  84.3  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4430  type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  45.05 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.462395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4385  type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  43.96 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4620  type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  43.96 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4528  type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  43.96 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.372665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4510  type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  43.96 
 
 		 147 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.993291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_16  conjugative transfer protein TrbB  36.27 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0035  hypothetical protein  31.62 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0027  hypothetical protein  30.3 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.520271  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6813  hypothetical protein  43.75 
 
 		 269 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4169  hypothetical protein  43.18 
 
 		 270 aa  51.6  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.347848 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4270  hypothetical protein  35.06 
 
 		 331 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000107556  normal  0.839186 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1526  hypothetical protein  35.29 
 
 		 291 aa  43.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00702216  normal  0.485209 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2662  hypothetical protein  35.29 
 
 		 288 aa  43.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.685452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2329  hypothetical protein  35.29 
 
 		 287 aa  43.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.370082  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0257  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.88 
 
 		 195 aa  42.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2220  lipolytic protein G-D-S-L family  39.34 
 
 		 214 aa  41.2  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>