18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4385 on replicon NC_011664
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011664  Sbal223_4385  type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  100 
 
 		 145 aa  296  4e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4620  type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  100 
 
 		 145 aa  296  4e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4528  type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  100 
 
 		 145 aa  296  4e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.372665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4430  type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  85.71 
 
 		 147 aa  254  4e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.462395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4510  type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  85.71 
 
 		 147 aa  252  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.993291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4434  Type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  83.67 
 
 		 147 aa  249  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_16  conjugative transfer protein TrbB  57.02 
 
 		 141 aa  145  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0017  conjugal transfer protein TrbB  43.96 
 
 		 181 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4301  conjugal transfer protein TrbB  36 
 
 		 200 aa  62  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.434158  normal  0.256366 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1526  hypothetical protein  36.46 
 
 		 291 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00702216  normal  0.485209 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2662  hypothetical protein  35 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.685452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2329  hypothetical protein  34.96 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.370082  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4169  hypothetical protein  37.97 
 
 		 270 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.347848 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0035  hypothetical protein  31.37 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6813  hypothetical protein  34.48 
 
 		 269 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0027  hypothetical protein  34.74 
 
 		 168 aa  57  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.520271  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2124  thioredoxin domain-containing protein  29.7 
 
 		 279 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0252  glutaredoxin 2  30.1 
 
 		 278 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>