29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_4000 on replicon NC_009426
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009426  Saro_4000  TraU family protein  100 
 
 		 340 aa  707    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5377  TraU family protein  65.88 
 
 		 340 aa  501  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.96345 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4231  hypothetical protein  50.9 
 
 		 328 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4174  TraU family protein  51.36 
 
 		 333 aa  336  2.9999999999999997e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.109495 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6806  TraU family protein  47.37 
 
 		 343 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2325  hypothetical protein  48.31 
 
 		 342 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.133454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2658  hypothetical protein  49.68 
 
 		 342 aa  305  6e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.274571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1530  TraU family protein  50.97 
 
 		 341 aa  302  7.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.283148  normal  0.998199 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0026  conjugal transfer pilus assembly protein TraU  44 
 
 		 330 aa  281  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0031  hypothetical protein  41.67 
 
 		 331 aa  276  5e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.957348  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_11  conjugative transfer protein TraU  41.34 
 
 		 334 aa  275  7e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4624  TraU family protein  41.12 
 
 		 337 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4439  TraU family protein  41.12 
 
 		 337 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4435  TraU family protein  41.12 
 
 		 337 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4532  TraU family protein  41.12 
 
 		 337 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4381  TraU family protein  41.12 
 
 		 337 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4505  TraU family protein  41.54 
 
 		 335 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0023  hypothetical protein  43.71 
 
 		 327 aa  266  4e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.621919  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4296  conjugal transfer pilus assembly protein TraU  42.35 
 
 		 334 aa  251  1e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.973053 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0249  TraU family protein  37.43 
 
 		 340 aa  231  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0311  TraU family protein  37.39 
 
 		 340 aa  231  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6167  sex pilus assembly and synthesis protein TraU  40.31 
 
 		 344 aa  219  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0349  conjugal DNA transfer protein  39.05 
 
 		 353 aa  217  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3772  TraU family protein  35.37 
 
 		 329 aa  194  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6232  TraU family protein  34.72 
 
 		 337 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0100  type IV conjugative transfer system protein TraU  32.94 
 
 		 335 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.185044 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2167  hypothetical protein  56.83 
 
 		 371 aa  166  5e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1096  conjugal transfer protein TraU, putative  33.76 
 
 		 416 aa  152  5e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.952693  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4207  TraU family protein  28.13 
 
 		 359 aa  140  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00154228  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>