29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6167 on replicon NC_007971
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007971  Rmet_6167  sex pilus assembly and synthesis protein TraU  100 
 
 		 344 aa  709    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0349  conjugal DNA transfer protein  72.01 
 
 		 353 aa  500  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6232  TraU family protein  44.38 
 
 		 337 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4174  TraU family protein  40.47 
 
 		 333 aa  266  5e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.109495 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6806  TraU family protein  39.83 
 
 		 343 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2325  hypothetical protein  40.31 
 
 		 342 aa  221  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.133454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2658  hypothetical protein  39.69 
 
 		 342 aa  218  8.999999999999998e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.274571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5377  TraU family protein  36.44 
 
 		 340 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.96345 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1530  TraU family protein  38.26 
 
 		 341 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.283148  normal  0.998199 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4000  TraU family protein  40.31 
 
 		 340 aa  202  7e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4231  hypothetical protein  34.02 
 
 		 328 aa  172  9e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0100  type IV conjugative transfer system protein TraU  34.77 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.185044 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4435  TraU family protein  30.06 
 
 		 337 aa  159  9e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4624  TraU family protein  30.06 
 
 		 337 aa  159  9e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4439  TraU family protein  30.06 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4532  TraU family protein  30.06 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4381  TraU family protein  30.06 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0026  conjugal transfer pilus assembly protein TraU  33.13 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4505  TraU family protein  29.77 
 
 		 335 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0031  hypothetical protein  31.78 
 
 		 331 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.957348  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4296  conjugal transfer pilus assembly protein TraU  33.01 
 
 		 334 aa  146  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.973053 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_11  conjugative transfer protein TraU  29.38 
 
 		 334 aa  146  5e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0249  TraU family protein  29.36 
 
 		 340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0311  TraU family protein  29.61 
 
 		 340 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0023  hypothetical protein  31.45 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.621919  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4207  TraU family protein  27.82 
 
 		 359 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00154228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3772  TraU family protein  30.35 
 
 		 329 aa  125  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1096  conjugal transfer protein TraU, putative  26.95 
 
 		 416 aa  104  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.952693  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2167  hypothetical protein  40.91 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>