29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_6232 on replicon NC_010070
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010070  Bmul_6232  TraU family protein  100 
 
 
337 aa  696    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6167  sex pilus assembly and synthesis protein TraU  44.65 
 
 
344 aa  292  7e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101379  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0349  conjugal DNA transfer protein  44.51 
 
 
353 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4174  TraU family protein  36.42 
 
 
333 aa  206  5e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.109495 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2325  hypothetical protein  38.65 
 
 
342 aa  194  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.133454  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6806  TraU family protein  35.96 
 
 
343 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2658  hypothetical protein  38.2 
 
 
342 aa  193  4e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.274571  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5377  TraU family protein  35.74 
 
 
340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.96345 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1530  TraU family protein  37.38 
 
 
341 aa  182  6e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.283148  normal  0.998199 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4000  TraU family protein  34.59 
 
 
340 aa  173  5e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0026  conjugal transfer pilus assembly protein TraU  33.23 
 
 
330 aa  161  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4231  hypothetical protein  31.75 
 
 
328 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0249  TraU family protein  31.66 
 
 
340 aa  158  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0311  TraU family protein  29.29 
 
 
340 aa  157  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0031  hypothetical protein  31.75 
 
 
331 aa  153  4e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.957348  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4296  conjugal transfer pilus assembly protein TraU  31.19 
 
 
334 aa  145  8.000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.973053 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3772  TraU family protein  28.82 
 
 
329 aa  145  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0023  hypothetical protein  30.6 
 
 
327 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.621919  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4439  TraU family protein  30.36 
 
 
337 aa  142  9e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_11  conjugative transfer protein TraU  30.24 
 
 
334 aa  142  9e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4505  TraU family protein  29.59 
 
 
335 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4435  TraU family protein  30.06 
 
 
337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235263  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0100  type IV conjugative transfer system protein TraU  31.94 
 
 
335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.185044 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4624  TraU family protein  30.06 
 
 
337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4532  TraU family protein  30.06 
 
 
337 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4381  TraU family protein  30.06 
 
 
337 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4207  TraU family protein  26.59 
 
 
359 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00154228  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1096  conjugal transfer protein TraU, putative  27.06 
 
 
416 aa  106  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.952693  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2167  hypothetical protein  42.86 
 
 
371 aa  63.5  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>