29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4505 on replicon NC_011665
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009661  Shew185_4439  TraU family protein  97.03 
 
 		 337 aa  683    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4381  TraU family protein  97.33 
 
 		 337 aa  684    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4532  TraU family protein  97.33 
 
 		 337 aa  684    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4624  TraU family protein  97.03 
 
 		 337 aa  683    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4435  TraU family protein  97.03 
 
 		 337 aa  683    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4505  TraU family protein  100 
 
 		 335 aa  698    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_11  conjugative transfer protein TraU  76.21 
 
 		 334 aa  531  1e-150  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0026  conjugal transfer pilus assembly protein TraU  50.16 
 
 		 330 aa  339  5e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0031  hypothetical protein  47.13 
 
 		 331 aa  318  1e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.957348  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0023  hypothetical protein  46.45 
 
 		 327 aa  299  4e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.621919  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4296  conjugal transfer pilus assembly protein TraU  46.77 
 
 		 334 aa  297  1e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.973053 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5377  TraU family protein  40.29 
 
 		 340 aa  269  4e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.96345 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4174  TraU family protein  40 
 
 		 333 aa  268  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.109495 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4231  hypothetical protein  40.12 
 
 		 328 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4000  TraU family protein  41.54 
 
 		 340 aa  252  7e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2325  hypothetical protein  42.72 
 
 		 342 aa  250  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.133454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2658  hypothetical protein  42.55 
 
 		 342 aa  247  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.274571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6806  TraU family protein  39.46 
 
 		 343 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1530  TraU family protein  40.78 
 
 		 341 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.283148  normal  0.998199 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0311  TraU family protein  35.05 
 
 		 340 aa  202  8e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0249  TraU family protein  34.55 
 
 		 340 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3772  TraU family protein  33.33 
 
 		 329 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6167  sex pilus assembly and synthesis protein TraU  29.94 
 
 		 344 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0100  type IV conjugative transfer system protein TraU  32.14 
 
 		 335 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.185044 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0349  conjugal DNA transfer protein  30.96 
 
 		 353 aa  144  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6232  TraU family protein  29.59 
 
 		 337 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4207  TraU family protein  28.57 
 
 		 359 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00154228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1096  conjugal transfer protein TraU, putative  26.6 
 
 		 416 aa  103  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.952693  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2167  hypothetical protein  42.06 
 
 		 371 aa  100  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>