29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4231 on replicon NC_007490
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007490  RSP_4231  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  677    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5377  TraU family protein  46.55 
 
 		 340 aa  329  4e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.96345 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4000  TraU family protein  50.63 
 
 		 340 aa  326  3e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4174  TraU family protein  41.46 
 
 		 333 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.109495 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0026  conjugal transfer pilus assembly protein TraU  44.76 
 
 		 330 aa  259  3e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_11  conjugative transfer protein TraU  40.67 
 
 		 334 aa  258  7e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4439  TraU family protein  40 
 
 		 337 aa  254  9e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4435  TraU family protein  40 
 
 		 337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4624  TraU family protein  40 
 
 		 337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4532  TraU family protein  40 
 
 		 337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4381  TraU family protein  40 
 
 		 337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4505  TraU family protein  40.12 
 
 		 335 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2325  hypothetical protein  44.44 
 
 		 342 aa  249  4e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.133454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2658  hypothetical protein  43.71 
 
 		 342 aa  248  9e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.274571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6806  TraU family protein  39.76 
 
 		 343 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0031  hypothetical protein  42.06 
 
 		 331 aa  243  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.957348  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4296  conjugal transfer pilus assembly protein TraU  43.93 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.973053 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1530  TraU family protein  42.67 
 
 		 341 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.283148  normal  0.998199 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0023  hypothetical protein  42.72 
 
 		 327 aa  236  4e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.621919  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0311  TraU family protein  35.03 
 
 		 340 aa  194  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0249  TraU family protein  35.82 
 
 		 340 aa  192  7e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6167  sex pilus assembly and synthesis protein TraU  33.64 
 
 		 344 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0349  conjugal DNA transfer protein  32.5 
 
 		 353 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3772  TraU family protein  31.56 
 
 		 329 aa  152  8.999999999999999e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6232  TraU family protein  31.75 
 
 		 337 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0100  type IV conjugative transfer system protein TraU  33.33 
 
 		 335 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.185044 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1096  conjugal transfer protein TraU, putative  29.97 
 
 		 416 aa  126  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.952693  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4207  TraU family protein  29.28 
 
 		 359 aa  125  7e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00154228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2167  hypothetical protein  48.31 
 
 		 371 aa  112  7.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>