29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1530 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1530  TraU family protein  100 
 
 		 341 aa  701    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.283148  normal  0.998199 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2325  hypothetical protein  87.34 
 
 		 342 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.133454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2658  hypothetical protein  87.34 
 
 		 342 aa  569  1e-161  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.274571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4174  TraU family protein  56.53 
 
 		 333 aa  401  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.109495 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6806  TraU family protein  49.71 
 
 		 343 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5377  TraU family protein  45.91 
 
 		 340 aa  322  9.000000000000001e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.96345 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4000  TraU family protein  50 
 
 		 340 aa  317  1e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4231  hypothetical protein  42.55 
 
 		 328 aa  276  5e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4435  TraU family protein  40.88 
 
 		 337 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4439  TraU family protein  40.88 
 
 		 337 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4624  TraU family protein  40.88 
 
 		 337 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4381  TraU family protein  40.88 
 
 		 337 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4532  TraU family protein  40.88 
 
 		 337 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4505  TraU family protein  40.71 
 
 		 335 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_11  conjugative transfer protein TraU  38.17 
 
 		 334 aa  251  2e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0031  hypothetical protein  36.84 
 
 		 331 aa  245  6e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.957348  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0023  hypothetical protein  40 
 
 		 327 aa  239  5.999999999999999e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.621919  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0026  conjugal transfer pilus assembly protein TraU  38.27 
 
 		 330 aa  235  9e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0249  TraU family protein  39.48 
 
 		 340 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6167  sex pilus assembly and synthesis protein TraU  39.01 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0311  TraU family protein  38.28 
 
 		 340 aa  226  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0349  conjugal DNA transfer protein  37.9 
 
 		 353 aa  225  9e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4296  conjugal transfer pilus assembly protein TraU  37.66 
 
 		 334 aa  219  7e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.973053 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6232  TraU family protein  37.2 
 
 		 337 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3772  TraU family protein  35.53 
 
 		 329 aa  188  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0100  type IV conjugative transfer system protein TraU  35.17 
 
 		 335 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.185044 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4207  TraU family protein  29.3 
 
 		 359 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00154228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1096  conjugal transfer protein TraU, putative  26.67 
 
 		 416 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.952693  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2167  hypothetical protein  52.33 
 
 		 371 aa  99.4  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>